More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1753 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 344 aa  687    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  49.85 
 
 		 366 aa  348  9e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  37.89 
 
 		 428 aa  253  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  39.84 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1061  cobalamin biosynthesis protein  48.86 
 
 		 220 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2574  cobalamin synthesis protein P47K  34.54 
 
 		 208 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1106  cobalamin synthesis protein P47K  36.13 
 
 		 230 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3476  cobalamin synthesis protein P47K  33.69 
 
 		 202 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  35.39 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  31.22 
 
 		 362 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  35.39 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  35.5 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  31.22 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  31.22 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  31.22 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  31.22 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  31.34 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  31.34 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  31.34 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  31.34 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  31.34 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  31.34 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  31.34 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2471  cobalamin synthesis protein P47K  26.18 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.286794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  31.34 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  30.88 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  32.31 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  35.57 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  36.81 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  32.57 
 
 		 625 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  36.81 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  35.36 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  35.52 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2991  cobalamin synthesis protein P47K  30.99 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0647494  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  32 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1227  cobalamin synthesis protein P47K  30.61 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.381423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  34.78 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0298  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.8 
 
 		 369 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0164  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.8 
 
 		 369 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  31.55 
 
 		 340 aa  99.8  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  33.65 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  32.22 
 
 		 331 aa  99.4  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  36.54 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  29.51 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  31.91 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  31.64 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.81 
 
 		 355 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  32.97 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.39 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.51 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  28.89 
 
 		 441 aa  97.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  32.4 
 
 		 351 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  29.74 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  33.15 
 
 		 363 aa  96.3  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  30.89 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  30.26 
 
 		 328 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  33.16 
 
 		 362 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.2 
 
 		 305 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.47 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  37.06 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  27.94 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.47 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.52 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.47 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.88 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  33.64 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.88 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  35.88 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  30.57 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.47 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  27.73 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  37.06 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 442 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  32.6 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0294  cobalamin synthesis protein P47K  33.17 
 
 		 381 aa  93.6  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.226941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07250  predicted GTPase, G3E family  30.23 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  31.46 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  31.84 
 
 		 350 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  27.57 
 
 		 395 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  32.62 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  32 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  27.57 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0421  hypothetical protein  33.51 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  27.78 
 
 		 527 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  30.86 
 
 		 325 aa  93.2  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  27.57 
 
 		 395 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  33.7 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 353 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  29.26 
 
 		 322 aa  93.2  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  31.89 
 
 		 325 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  30.62 
 
 		 395 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  32.62 
 
 		 362 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  26.58 
 
 		 424 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  32.2 
 
 		 345 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  30.93 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  28.07 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  30.04 
 
 		 313 aa  92.8  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  31.43 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  32 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>