More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1056 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  100 
 
 		 428 aa  855    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  54.59 
 
 		 381 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  38.73 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  38.37 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1061  cobalamin biosynthesis protein  40.66 
 
 		 220 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1106  cobalamin synthesis protein P47K  34.9 
 
 		 230 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2574  cobalamin synthesis protein P47K  33.51 
 
 		 208 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3476  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 202 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  36.61 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  32.04 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  34.81 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  33.17 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  32.4 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  32.4 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  31.6 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  33.66 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  34.41 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.25 
 
 		 355 aa  103  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  33.89 
 
 		 625 aa  103  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  35.39 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.7 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  33.87 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  32.37 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  32.6 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  30.2 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  32.04 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  35.16 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  33.85 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  30.83 
 
 		 460 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  35.12 
 
 		 310 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  30.2 
 
 		 460 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  31.84 
 
 		 648 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  34.68 
 
 		 331 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  32.09 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  32.7 
 
 		 395 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  32.6 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  31.9 
 
 		 415 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  32.7 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  32.7 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  32.22 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0421  hypothetical protein  32.02 
 
 		 307 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  33.88 
 
 		 367 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.07 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  29.33 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  35.09 
 
 		 344 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  31.02 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  30.23 
 
 		 457 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  30 
 
 		 403 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  30.95 
 
 		 333 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 		 323 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  34.5 
 
 		 342 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  32.6 
 
 		 358 aa  96.3  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.46 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  33.52 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  34.46 
 
 		 343 aa  96.3  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  33.18 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  30.37 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  31.67 
 
 		 310 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  30.37 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26190  predicted GTPase, G3E family  32.16 
 
 		 329 aa  95.9  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  31.67 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  33.18 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  31.25 
 
 		 338 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  29.91 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2471  cobalamin synthesis protein P47K  31.31 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.286794  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  30.24 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  32.86 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  30.99 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  32.86 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  32.71 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  32.77 
 
 		 640 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  32.04 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  33.51 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  35.14 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  31.75 
 
 		 395 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.6 
 
 		 345 aa  94.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  31.84 
 
 		 320 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  33.7 
 
 		 360 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  32.24 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  31.75 
 
 		 395 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  31.36 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  30.37 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  34.44 
 
 		 323 aa  94.4  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  31.75 
 
 		 527 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  33.93 
 
 		 328 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  26.4 
 
 		 395 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0164  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.43 
 
 		 369 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  29.67 
 
 		 364 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0298  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.43 
 
 		 369 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  32.04 
 
 		 347 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.58 
 
 		 349 aa  93.2  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  30.58 
 
 		 349 aa  93.2  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.34 
 
 		 307 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.3 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  31.67 
 
 		 345 aa  93.2  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  31.46 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  33.14 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6542  cobalamin synthesis protein, P47K  27.98 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>