More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3476 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3476  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  33.69 
 
 		 344 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  31.89 
 
 		 366 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  33.33 
 
 		 428 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  34.76 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  36.25 
 
 		 308 aa  105  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2574  cobalamin synthesis protein P47K  32.43 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  31.22 
 
 		 381 aa  104  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  31.32 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  30.77 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.85 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1106  cobalamin synthesis protein P47K  32.81 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  31.35 
 
 		 640 aa  98.6  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  36.52 
 
 		 614 aa  97.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  36.11 
 
 		 624 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1061  cobalamin biosynthesis protein  29.28 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  29.51 
 
 		 310 aa  92.8  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  29.65 
 
 		 378 aa  92.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  35.83 
 
 		 336 aa  92.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  33.55 
 
 		 360 aa  92.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  36.13 
 
 		 330 aa  91.7  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0711  cobalamin synthesis protein, P47K  30.27 
 
 		 308 aa  91.7  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0727  cobalamin synthesis protein P47K  30.27 
 
 		 308 aa  91.7  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  33.01 
 
 		 417 aa  91.3  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  33.5 
 
 		 406 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  32.93 
 
 		 340 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  38.06 
 
 		 331 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  35.62 
 
 		 351 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  32.16 
 
 		 360 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  32.71 
 
 		 375 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.48 
 
 		 349 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  32.58 
 
 		 318 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  33.17 
 
 		 368 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0193  cobalamin synthesis protein P47K  34.92 
 
 		 320 aa  88.6  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.9456  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  36.2 
 
 		 328 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  33.17 
 
 		 368 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  36.2 
 
 		 328 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  36.2 
 
 		 328 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  36.2 
 
 		 328 aa  88.2  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  36.2 
 
 		 328 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  36.2 
 
 		 328 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  36.2 
 
 		 328 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  36.2 
 
 		 328 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  36.2 
 
 		 328 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  34.8 
 
 		 349 aa  88.2  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.8 
 
 		 349 aa  88.2  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  32.18 
 
 		 345 aa  87.8  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.5 
 
 		 319 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.72 
 
 		 316 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  30 
 
 		 319 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  32.68 
 
 		 368 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  31.75 
 
 		 334 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  33.97 
 
 		 324 aa  87.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.5 
 
 		 316 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  33.15 
 
 		 357 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  30 
 
 		 316 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.61 
 
 		 316 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  33.72 
 
 		 625 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  32.67 
 
 		 335 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  33.13 
 
 		 324 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.5 
 
 		 316 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  30.53 
 
 		 316 aa  86.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  31.41 
 
 		 325 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.34 
 
 		 334 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  31.52 
 
 		 347 aa  85.5  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.58 
 
 		 316 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.53 
 
 		 316 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 		 423 aa  85.5  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  30.56 
 
 		 410 aa  85.5  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  34.59 
 
 		 328 aa  85.1  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  35.03 
 
 		 328 aa  84.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 		 335 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  34.39 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  31.88 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  30.9 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  32.06 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  34.71 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  31.55 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  29.61 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.65 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  33.52 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  31.11 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  33.54 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.26 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  32 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.5 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  34.38 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  29.07 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  30.6 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  30.56 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  31.11 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  29.27 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  34.38 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  34.38 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  30.37 
 
 		 395 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.17 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.52 
 
 		 399 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  34.38 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.01 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>