More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0344 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  100 
 
 		 308 aa  634    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0727  cobalamin synthesis protein P47K  55.19 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0711  cobalamin synthesis protein, P47K  55.19 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  32.89 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.11 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  34 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.44 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.89 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.89 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.67 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.89 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.79 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  32.79 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  32.79 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  32.76 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  32.76 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  33.45 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  30.85 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  28.34 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  28.75 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  26.54 
 
 		 400 aa  122  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  24.19 
 
 		 401 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  24.73 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  28.33 
 
 		 352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  30.3 
 
 		 354 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  26.74 
 
 		 356 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  25.86 
 
 		 415 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  24.26 
 
 		 401 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  30.3 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  26.02 
 
 		 402 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  26.02 
 
 		 423 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  26.02 
 
 		 423 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  24.59 
 
 		 402 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  35.96 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  27.72 
 
 		 625 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  26.16 
 
 		 640 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  25.47 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  28.69 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  24.13 
 
 		 400 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.39 
 
 		 402 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  24.66 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  34.98 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  25 
 
 		 648 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  25.07 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  29.26 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  27.27 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  26.6 
 
 		 396 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  27.19 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  30.09 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  25.24 
 
 		 403 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  25.57 
 
 		 364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  27.21 
 
 		 423 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  28.22 
 
 		 596 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  28.72 
 
 		 400 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  28.72 
 
 		 400 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  27.36 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  29.63 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  25.34 
 
 		 401 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  24.27 
 
 		 402 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  24.05 
 
 		 402 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  27.27 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  27.42 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  24.65 
 
 		 388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  27.42 
 
 		 395 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  28 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  27.36 
 
 		 441 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  24.87 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  26.01 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  27.86 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  28.16 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  27.42 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  24.78 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  30 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  23.91 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  27.63 
 
 		 527 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  27.42 
 
 		 395 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  25.34 
 
 		 406 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  25.89 
 
 		 408 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  29.57 
 
 		 470 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  26.09 
 
 		 417 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  28 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  29.57 
 
 		 437 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  23.85 
 
 		 401 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.42 
 
 		 349 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  25.16 
 
 		 406 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  29.57 
 
 		 437 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  25 
 
 		 420 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  27.42 
 
 		 395 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  27.54 
 
 		 349 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  27.42 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  25.41 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  28.03 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  28.8 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  27 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  32.85 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  25.16 
 
 		 407 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.7 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  25.96 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>