More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1106 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1106  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 230 aa  463  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2574  cobalamin synthesis protein P47K  36.1 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  38.5 
 
 		 381 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  34.72 
 
 		 428 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  36.13 
 
 		 344 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  31.77 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  35.6 
 
 		 640 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  34.59 
 
 		 316 aa  99.8  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.17 
 
 		 307 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  35.64 
 
 		 307 aa  95.5  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  35.42 
 
 		 328 aa  95.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.64 
 
 		 318 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.45 
 
 		 305 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  35.64 
 
 		 307 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.36 
 
 		 307 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.36 
 
 		 307 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.64 
 
 		 320 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.64 
 
 		 307 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  34.22 
 
 		 310 aa  93.2  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3476  cobalamin synthesis protein P47K  32.81 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  34.08 
 
 		 614 aa  92.8  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  32.95 
 
 		 308 aa  90.9  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  30.46 
 
 		 353 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1061  cobalamin biosynthesis protein  29.1 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  33.86 
 
 		 353 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  34.87 
 
 		 349 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26190  predicted GTPase, G3E family  27.81 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 352 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  29.44 
 
 		 349 aa  89.4  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  31.91 
 
 		 596 aa  89.4  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  30.65 
 
 		 460 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  31.68 
 
 		 355 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  30.96 
 
 		 460 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  29.95 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  30.35 
 
 		 320 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  29.9 
 
 		 404 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  29.35 
 
 		 308 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  28.28 
 
 		 362 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  32.11 
 
 		 625 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  31.22 
 
 		 323 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  29.89 
 
 		 308 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  31.22 
 
 		 323 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  32.82 
 
 		 319 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  30.73 
 
 		 363 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  30.69 
 
 		 323 aa  86.3  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.82 
 
 		 316 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  25.95 
 
 		 360 aa  85.9  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  30.73 
 
 		 362 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  31.75 
 
 		 354 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  30.73 
 
 		 362 aa  85.5  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  31.18 
 
 		 323 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  31.79 
 
 		 316 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  29.08 
 
 		 449 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  29.08 
 
 		 449 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.79 
 
 		 316 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  29.59 
 
 		 460 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  29.57 
 
 		 384 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  28.93 
 
 		 452 aa  84.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.79 
 
 		 316 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.28 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  30.14 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.28 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  28.57 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.28 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  30.32 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  32.46 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  28.88 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.17 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  29 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  30.48 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  28.95 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  32.31 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  27.96 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  29.61 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  30.32 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.79 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  29 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  29.47 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  31.79 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0711  cobalamin synthesis protein, P47K  32.76 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  32.11 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  31.58 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  29 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  29 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  30.23 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  29 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  29 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0727  cobalamin synthesis protein P47K  32.76 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  30.37 
 
 		 493 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  29 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  29.41 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  32.98 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  29 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  25.66 
 
 		 442 aa  82.8  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  32.98 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  25.55 
 
 		 442 aa  82.8  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  31.58 
 
 		 350 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  32 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  30.33 
 
 		 346 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  26.63 
 
 		 379 aa  82  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>