More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2574 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2574  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1106  cobalamin synthesis protein P47K  36.1 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  38.54 
 
 		 366 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  34.54 
 
 		 344 aa  122  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  34.2 
 
 		 381 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  33.16 
 
 		 428 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3476  cobalamin synthesis protein P47K  32.43 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1061  cobalamin biosynthesis protein  33.68 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 320 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  32.28 
 
 		 614 aa  92.8  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 320 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  29.95 
 
 		 395 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  34.03 
 
 		 350 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  30.3 
 
 		 338 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  29.85 
 
 		 308 aa  90.5  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  34.03 
 
 		 361 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.51 
 
 		 353 aa  89  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  34.38 
 
 		 349 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  34.01 
 
 		 313 aa  89.4  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  34.03 
 
 		 350 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  30.35 
 
 		 293 aa  89  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  29.95 
 
 		 395 aa  89  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  35.07 
 
 		 394 aa  89  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  33.68 
 
 		 363 aa  89  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  31.28 
 
 		 596 aa  89  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  32.98 
 
 		 355 aa  89  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  29.35 
 
 		 308 aa  88.6  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  32.8 
 
 		 358 aa  88.2  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  33.53 
 
 		 308 aa  88.6  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  29.49 
 
 		 395 aa  88.2  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.98 
 
 		 345 aa  88.2  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2991  cobalamin synthesis protein P47K  31.22 
 
 		 369 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0647494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  31.22 
 
 		 493 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  34.01 
 
 		 404 aa  87.8  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  29.49 
 
 		 395 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  32.8 
 
 		 347 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  31.75 
 
 		 335 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  29.03 
 
 		 527 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  29.19 
 
 		 310 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  29.79 
 
 		 310 aa  86.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  31.52 
 
 		 316 aa  87  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.16 
 
 		 320 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  29.03 
 
 		 395 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  27.23 
 
 		 625 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  32.98 
 
 		 353 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  29.49 
 
 		 395 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  31.75 
 
 		 329 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  30.6 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  31.61 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  29.03 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  29.89 
 
 		 640 aa  84  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  28.26 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  31.75 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  31.75 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1227  cobalamin synthesis protein P47K  27.23 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.381423 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0164  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.39 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0298  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.39 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  31.72 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  30.37 
 
 		 355 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0421  hypothetical protein  33.87 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  30.57 
 
 		 415 aa  82  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  32.64 
 
 		 366 aa  82  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  31.93 
 
 		 328 aa  82  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  32.54 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  27.94 
 
 		 648 aa  82  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  31.91 
 
 		 460 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.79 
 
 		 307 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  31.91 
 
 		 460 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  31.12 
 
 		 365 aa  81.6  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.79 
 
 		 307 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  30.46 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.93 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  31.38 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.93 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.93 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  30.46 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  31.47 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  29.95 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.93 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  27.23 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  31.93 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  27.98 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  30.98 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  30.77 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.93 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  27.98 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  28.02 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  31.93 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  31.22 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.88 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  31.79 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  28.04 
 
 		 349 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  28.43 
 
 		 336 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  29.47 
 
 		 337 aa  78.6  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  31.92 
 
 		 339 aa  78.2  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.69 
 
 		 323 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.69 
 
 		 323 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  28.43 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  27.59 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>