More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0182 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 308 aa  610  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  31.65 
 
 		 625 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  30.46 
 
 		 648 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  29.39 
 
 		 640 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  31.61 
 
 		 596 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  29.13 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  29.13 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  29.13 
 
 		 614 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  35.63 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  38.82 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  40 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  34.48 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  38.51 
 
 		 380 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.45 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  35.35 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  35.4 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.45 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  29.63 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.94 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  36.26 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  27.9 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  29.45 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  28.25 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.11 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  28.3 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  27.44 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  26.79 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  26.5 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.53 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.27 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.63 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  29.32 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  38.24 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  32.57 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.63 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  35.88 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  35.88 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  33.71 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  38.24 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  38.24 
 
 		 362 aa  116  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  34.5 
 
 		 338 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  33.14 
 
 		 372 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  26.05 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  35.88 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  28.94 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  28.39 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  27.1 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  26.3 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  36.02 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  29.07 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.26 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.26 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.26 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.26 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  27.5 
 
 		 320 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.26 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.26 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  28.94 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  28 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  35.35 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  28.23 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  28.48 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  36.63 
 
 		 355 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.94 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  37.43 
 
 		 383 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  36.63 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  36.84 
 
 		 362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  28.32 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  36.84 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  26.73 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  29.07 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  35.48 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  35.84 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  26.75 
 
 		 325 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  35.84 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  27.18 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  29.3 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.71 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  27.22 
 
 		 624 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  33.33 
 
 		 460 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  33.16 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  33.33 
 
 		 460 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  25.38 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  32.23 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.16 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  35.47 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  30.49 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  30.49 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  28.62 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  30.49 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  36.42 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  30.49 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  30.49 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.31 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  27.83 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  30.49 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.16 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  34.5 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>