More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7626 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  100 
 
 
345 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6051  cobalamin synthesis protein P47K  76.06 
 
 
330 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  43.96 
 
 
318 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  49.42 
 
 
310 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  42.6 
 
 
336 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  39.54 
 
 
320 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  32.95 
 
 
364 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  34.06 
 
 
362 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  34.83 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 
369 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  34.19 
 
 
320 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  30 
 
 
349 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  35.91 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  35.97 
 
 
349 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.15 
 
 
335 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  28.9 
 
 
327 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.08 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  30.18 
 
 
353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  32.97 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  37.55 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  32.39 
 
 
332 aa  132  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  37.22 
 
 
303 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  32.34 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  36.74 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  31.01 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6990  cobalamin synthesis protein P47K  37.01 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  35.74 
 
 
309 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  25.96 
 
 
342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  32.21 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4765  cobalamin synthesis protein P47K  34.95 
 
 
330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.96 
 
 
323 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  26.75 
 
 
344 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  32.26 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  32.26 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  31.34 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  45.75 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  30.87 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  31.06 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  31.5 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  31.06 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.01 
 
 
320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  28.04 
 
 
341 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  32.5 
 
 
343 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  31.23 
 
 
356 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  33.67 
 
 
648 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  26.9 
 
 
338 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  36.5 
 
 
360 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  34.98 
 
 
311 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  26.61 
 
 
349 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  29.01 
 
 
394 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  31.39 
 
 
287 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 
367 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  35.47 
 
 
369 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  26.6 
 
 
319 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  38.74 
 
 
355 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  26.28 
 
 
316 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  39.34 
 
 
350 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.71 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.28 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  35 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  35.38 
 
 
353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.6 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  32.72 
 
 
328 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  36.89 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  36.84 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  30.5 
 
 
373 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.41 
 
 
316 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.78 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  28.22 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  32.33 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  32.54 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.04 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  28.36 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  39.67 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  29.97 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  31.9 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  38.66 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  34.65 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  34.29 
 
 
364 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.04 
 
 
319 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  27.11 
 
 
379 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.04 
 
 
316 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  27.04 
 
 
316 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.64 
 
 
316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  29.74 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  40.11 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.64 
 
 
316 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  35.5 
 
 
372 aa  116  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  27.04 
 
 
319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  28.71 
 
 
366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  37.72 
 
 
493 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  33.78 
 
 
327 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  34.21 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  32.84 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  31 
 
 
323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  26.05 
 
 
308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  35.45 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  31 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  25.86 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  28.97 
 
 
339 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>