More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_A0164 on replicon NC_005707
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005707  BCE_A0164  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  100 
 
 
369 aa  762    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0298  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  100 
 
 
369 aa  762    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2991  cobalamin synthesis protein P47K  58.63 
 
 
369 aa  460  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0647494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2842  cobalamin synthesis protein P47K  36.68 
 
 
384 aa  253  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1916  cobalamin synthesis protein P47K  35.07 
 
 
363 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2471  cobalamin synthesis protein P47K  34.85 
 
 
371 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.286794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  29.8 
 
 
344 aa  99.8  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  24.54 
 
 
366 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  31.47 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  27.96 
 
 
428 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07250  predicted GTPase, G3E family  31.53 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  32.97 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2574  cobalamin synthesis protein P47K  32.39 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  29.9 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  28.57 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.41 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  32.46 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  28.44 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  31.87 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  31.12 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  25.93 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1061  cobalamin biosynthesis protein  28.08 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  25.5 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  32.98 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  32.07 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  32.07 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  32.07 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  32.07 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  32.07 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  32.07 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  32.07 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  32.07 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  32.07 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  30.05 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  28.42 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  30.22 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  30.22 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  30.22 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  30.22 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  30.22 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  32.16 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  32.26 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  26.96 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.55 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  30.98 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  30.85 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  29.24 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  28.65 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  29.59 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  31.52 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  29.44 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  28.21 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  28.21 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  28.04 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  26.79 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  30.98 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  32.26 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  32.16 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  32.45 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  32.45 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  28.64 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  27.75 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  28.04 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  30.57 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.82 
 
 
307 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.82 
 
 
307 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  31.25 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  26.6 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  27.93 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  26.19 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0399  cobalamin synthesis protein P47K  28.3 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414566  normal  0.973857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1028  cobalamin synthesis protein P47K  29.59 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.906843  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  30.48 
 
 
493 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  29.69 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  28.71 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  30.17 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  26.9 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  27.37 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  28.65 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  29.03 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  26.67 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  30.12 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  29.38 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.21 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.17 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  25.89 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  27.17 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.17 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  27.51 
 
 
401 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.17 
 
 
307 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  26.34 
 
 
403 aa  67  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.59 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  27.86 
 
 
540 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  28.8 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.17 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  25.6 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  28.49 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  27.27 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>