More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07250 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_07250  predicted GTPase, G3E family  100 
 
 		 421 aa  861    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0294  cobalamin synthesis protein P47K  59.92 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.226941 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  37.59 
 
 		 394 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  38.34 
 
 		 437 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  38.66 
 
 		 433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  35.21 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  35.57 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  37.27 
 
 		 402 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  35.7 
 
 		 395 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  35.46 
 
 		 395 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  35.7 
 
 		 395 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  35.46 
 
 		 527 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  35.7 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  38.16 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  34.65 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  34.65 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  35.46 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  34.75 
 
 		 395 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  38.16 
 
 		 436 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  36.08 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  38.66 
 
 		 470 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  38.66 
 
 		 437 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  38.66 
 
 		 437 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  34.38 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  36.84 
 
 		 423 aa  249  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  36.32 
 
 		 406 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  35.08 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  35.8 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  36.85 
 
 		 406 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  36.32 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  35.2 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  34.62 
 
 		 401 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  36.21 
 
 		 407 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2216  cobalamin synthesis protein P47K  37.47 
 
 		 448 aa  242  7.999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  37.08 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.33 
 
 		 519 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  37 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  35.22 
 
 		 401 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  36.84 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  35.5 
 
 		 423 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  34.69 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  36.6 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  34.82 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  34.98 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.71 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  34.86 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  33.87 
 
 		 410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  36.01 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  35.46 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.05 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  34.93 
 
 		 423 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.05 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  34.81 
 
 		 446 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  34.12 
 
 		 401 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  35.53 
 
 		 423 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  35.53 
 
 		 423 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  36.89 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35 
 
 		 446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  35.19 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 		 402 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  34.66 
 
 		 395 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  34.43 
 
 		 396 aa  232  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  33.99 
 
 		 441 aa  232  9e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.78 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  36.78 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  36.3 
 
 		 404 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  34.58 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.58 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.58 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  32.23 
 
 		 424 aa  229  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.76 
 
 		 446 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  34.12 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  36.78 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  34.99 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  34.02 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0422  cobalamin synthesis protein P47K  36.36 
 
 		 442 aa  227  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  34.52 
 
 		 407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  35.21 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  34.37 
 
 		 540 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.98 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  33.98 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  33.73 
 
 		 415 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  33.8 
 
 		 422 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  35.92 
 
 		 376 aa  223  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  32.61 
 
 		 401 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  33.57 
 
 		 373 aa  222  8e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  32.77 
 
 		 401 aa  222  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  32.77 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  35.45 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  34.04 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  32.55 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  32.84 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  33.41 
 
 		 403 aa  219  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  32.31 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  34.31 
 
 		 442 aa  217  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  32.68 
 
 		 401 aa  217  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  32.52 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  34.51 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  32.39 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>