More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2995 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
410 aa  823    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2715  cobalamin synthesis protein P47K  66.36 
 
 
431 aa  530  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0846  cobalamin synthesis protein P47K  61.14 
 
 
449 aa  509  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.256536  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  47.91 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  47.47 
 
 
373 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  46.8 
 
 
401 aa  315  7e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0422  cobalamin synthesis protein P47K  42.79 
 
 
442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  45.27 
 
 
376 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  45.39 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2216  cobalamin synthesis protein P47K  41.94 
 
 
448 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  41.73 
 
 
395 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  45.22 
 
 
373 aa  301  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  40.49 
 
 
395 aa  299  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  40.99 
 
 
395 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  40.49 
 
 
395 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  40.99 
 
 
527 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  40.99 
 
 
395 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  40.74 
 
 
395 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  39.75 
 
 
395 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  42.08 
 
 
400 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  42.08 
 
 
400 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  42.65 
 
 
417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  39.11 
 
 
394 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  42.86 
 
 
407 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  39.64 
 
 
400 aa  278  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  42.01 
 
 
401 aa  276  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  40.44 
 
 
399 aa  270  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  42.93 
 
 
406 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  41.02 
 
 
404 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.83 
 
 
400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.83 
 
 
400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  41.52 
 
 
423 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  40.19 
 
 
406 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  41.91 
 
 
402 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  40.34 
 
 
402 aa  266  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  40.48 
 
 
436 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  40.96 
 
 
403 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  41.53 
 
 
403 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  40.48 
 
 
436 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  41.91 
 
 
423 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  41.91 
 
 
423 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  41.93 
 
 
410 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  40.38 
 
 
437 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  39.33 
 
 
433 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  39.61 
 
 
404 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  43.48 
 
 
388 aa  263  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  40.19 
 
 
401 aa  262  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  41.18 
 
 
423 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  41.12 
 
 
406 aa  262  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40 
 
 
446 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  39.61 
 
 
408 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  41.12 
 
 
397 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40 
 
 
446 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.86 
 
 
446 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  39.52 
 
 
446 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  38.83 
 
 
423 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  39.52 
 
 
446 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  41.85 
 
 
407 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.45 
 
 
446 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  40.24 
 
 
402 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  40.29 
 
 
407 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  39.11 
 
 
397 aa  259  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  41.26 
 
 
422 aa  259  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  40.84 
 
 
394 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40 
 
 
519 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  38.88 
 
 
416 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  38.85 
 
 
437 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  39.37 
 
 
415 aa  253  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  39.76 
 
 
400 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  38.85 
 
 
470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  38.85 
 
 
437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.46 
 
 
399 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  40.81 
 
 
401 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  40.86 
 
 
401 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  40.3 
 
 
406 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  39.67 
 
 
400 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  39.34 
 
 
410 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  36.52 
 
 
402 aa  249  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  40.77 
 
 
403 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  40.4 
 
 
408 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  35.48 
 
 
403 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  38.55 
 
 
401 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  41.12 
 
 
540 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  39.6 
 
 
402 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  37.08 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  36.55 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  39.52 
 
 
435 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  39.8 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  40.05 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  36.32 
 
 
442 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  37.08 
 
 
438 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0399  cobalamin synthesis protein P47K  37.19 
 
 
441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414566  normal  0.973857 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  38.05 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  40.96 
 
 
406 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.59 
 
 
402 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  37.84 
 
 
399 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  38.21 
 
 
402 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4084  cobalamin synthesis protein, P47K  39.5 
 
 
420 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4282  cobalamin synthesis protein, P47K  39.5 
 
 
420 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  40.21 
 
 
393 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0323303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>