More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1834 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 373 aa  752    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  68.73 
 
 		 373 aa  509  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  61.33 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  48.74 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  47.24 
 
 		 401 aa  328  7e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  45.22 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  42.58 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  40.15 
 
 		 394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  39.2 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  38.69 
 
 		 527 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  38.69 
 
 		 395 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  41.84 
 
 		 417 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  38.69 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  38.44 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  38.69 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  37.44 
 
 		 395 aa  279  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  41.25 
 
 		 400 aa  278  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  41.25 
 
 		 400 aa  278  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  38.19 
 
 		 395 aa  278  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  40.34 
 
 		 437 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  39.8 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  40.31 
 
 		 406 aa  269  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2715  cobalamin synthesis protein P47K  42.65 
 
 		 431 aa  267  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  39.07 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  37.38 
 
 		 423 aa  265  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  40.2 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  38.87 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  39.04 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  39.95 
 
 		 436 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  40.61 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  40.4 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  38.39 
 
 		 410 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  41.98 
 
 		 410 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  40.67 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  42.36 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  41.75 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  39.75 
 
 		 470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  39.75 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  40.1 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  38.15 
 
 		 438 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.41 
 
 		 519 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  40.72 
 
 		 404 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  40.76 
 
 		 422 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  37.38 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  37.92 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  41.93 
 
 		 540 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.38 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  39.69 
 
 		 423 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  39.69 
 
 		 423 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.38 
 
 		 446 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  37.94 
 
 		 407 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  39.69 
 
 		 423 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  37.38 
 
 		 446 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.38 
 
 		 446 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  39.69 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.19 
 
 		 399 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.63 
 
 		 446 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  40.51 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  37.81 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  36.67 
 
 		 415 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0846  cobalamin synthesis protein P47K  40.21 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.256536  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  42.27 
 
 		 406 aa  246  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  38.9 
 
 		 435 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  38.67 
 
 		 401 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  38.54 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  36.67 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  38.2 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  38.21 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  38.27 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  40 
 
 		 403 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  40.25 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  40.2 
 
 		 406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  37.5 
 
 		 402 aa  243  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  40.1 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  39.54 
 
 		 410 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  38.61 
 
 		 404 aa  242  9e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  39.64 
 
 		 388 aa  242  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.79 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.79 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  37.19 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  39.9 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.08 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  36.5 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  39.95 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  40.1 
 
 		 406 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  36.07 
 
 		 403 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  39.39 
 
 		 399 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  36.68 
 
 		 401 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  36.68 
 
 		 402 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0399  cobalamin synthesis protein P47K  41.6 
 
 		 441 aa  236  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414566  normal  0.973857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  39.13 
 
 		 395 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  37.16 
 
 		 397 aa  235  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  36.69 
 
 		 400 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  37.34 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  39.64 
 
 		 402 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  38.08 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  40.41 
 
 		 441 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  38.82 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  38.34 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>