More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0422 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0422  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
442 aa  885    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2216  cobalamin synthesis protein P47K  72.63 
 
 
448 aa  635    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  41.56 
 
 
424 aa  319  6e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  43.16 
 
 
401 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  43.4 
 
 
410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  41.57 
 
 
400 aa  313  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  37.05 
 
 
394 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2715  cobalamin synthesis protein P47K  41.65 
 
 
431 aa  290  3e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0846  cobalamin synthesis protein P47K  38.21 
 
 
449 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.256536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  38.3 
 
 
400 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  38.3 
 
 
400 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  35.7 
 
 
395 aa  270  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  34.55 
 
 
395 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  36.09 
 
 
400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  34.55 
 
 
395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  34.78 
 
 
395 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  34.32 
 
 
395 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  34.55 
 
 
395 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  34.55 
 
 
527 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  34.1 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  38.14 
 
 
376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  36.57 
 
 
417 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  37.95 
 
 
433 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  36.9 
 
 
423 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  36.9 
 
 
423 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  37.13 
 
 
423 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  36.32 
 
 
408 aa  239  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  36.45 
 
 
402 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  37.28 
 
 
436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  37.05 
 
 
436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  36.28 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.56 
 
 
519 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  36.05 
 
 
397 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  36.83 
 
 
437 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  36.16 
 
 
446 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  35.07 
 
 
416 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  35.03 
 
 
423 aa  229  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36 
 
 
446 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  34.49 
 
 
399 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36 
 
 
446 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  36 
 
 
446 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36 
 
 
446 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  35.52 
 
 
423 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36 
 
 
446 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  33.12 
 
 
442 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  37.36 
 
 
435 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  36.5 
 
 
435 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  35.88 
 
 
373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  34.31 
 
 
406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  33.49 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  36.38 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  36.38 
 
 
437 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  32.71 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  36.61 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  32.67 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  34.15 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 
405 aa  221  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  34.19 
 
 
401 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  34.88 
 
 
400 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  36.73 
 
 
406 aa  220  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 
406 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  33.72 
 
 
402 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  33.41 
 
 
407 aa  219  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.64 
 
 
403 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  34.24 
 
 
396 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  33.1 
 
 
401 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  34.03 
 
 
402 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  33.95 
 
 
401 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  35.46 
 
 
415 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  34.57 
 
 
401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  32.51 
 
 
403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  35.08 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  35.85 
 
 
406 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3235  cobalamin synthesis protein P47K  34.35 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  32.89 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  33.96 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  33.8 
 
 
402 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  34.76 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  34.24 
 
 
401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  33.26 
 
 
402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  35.31 
 
 
540 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  33.41 
 
 
395 aa  213  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  36.16 
 
 
424 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  34.75 
 
 
404 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  36.34 
 
 
373 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4084  cobalamin synthesis protein, P47K  33.88 
 
 
420 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4282  cobalamin synthesis protein, P47K  33.88 
 
 
420 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  35.58 
 
 
393 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  33.49 
 
 
408 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  33.89 
 
 
407 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  34.82 
 
 
438 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  34.01 
 
 
407 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  31.8 
 
 
441 aa  209  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  35.08 
 
 
410 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  35.24 
 
 
403 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  36.85 
 
 
422 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  34.83 
 
 
410 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  32.16 
 
 
420 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  34.15 
 
 
438 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07250  predicted GTPase, G3E family  34.77 
 
 
421 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>