More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5361 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  100 
 
 		 402 aa  824    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  75.87 
 
 		 403 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  76.37 
 
 		 402 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  77.5 
 
 		 400 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  99 
 
 		 402 aa  815    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  81.05 
 
 		 401 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  95.76 
 
 		 401 aa  787    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  77.81 
 
 		 401 aa  646    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  79.8 
 
 		 401 aa  668    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  77.75 
 
 		 400 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  91.29 
 
 		 402 aa  756    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  63.91 
 
 		 403 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  64.23 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  61.56 
 
 		 402 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  62.94 
 
 		 410 aa  521  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  59.95 
 
 		 402 aa  519  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  63.2 
 
 		 407 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  62.63 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  62.63 
 
 		 423 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  62.85 
 
 		 396 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  60.1 
 
 		 406 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  62.88 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  62.88 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  62.53 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  60.41 
 
 		 395 aa  494  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  62.72 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  63.1 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  60.34 
 
 		 435 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  60.1 
 
 		 435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  60.15 
 
 		 424 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  59.03 
 
 		 415 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  60.81 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  59.39 
 
 		 408 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  58.29 
 
 		 402 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  56.68 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  56.68 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  53.45 
 
 		 420 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  56.82 
 
 		 406 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  54.8 
 
 		 416 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  57.39 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  55.56 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  53.48 
 
 		 437 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  53.68 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  53.48 
 
 		 470 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  53.48 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  52.73 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  53.48 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  52.73 
 
 		 436 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  54.81 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  54.93 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  55.31 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  54.75 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  54.7 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  54.84 
 
 		 406 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  55.42 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  54.43 
 
 		 438 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  54.18 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  52.16 
 
 		 519 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3235  cobalamin synthesis protein P47K  53.94 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4084  cobalamin synthesis protein, P47K  52.79 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4282  cobalamin synthesis protein, P47K  52.79 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  53.73 
 
 		 407 aa  418  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  53.73 
 
 		 399 aa  418  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  53.6 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  53.63 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6542  cobalamin synthesis protein, P47K  53.87 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  55.14 
 
 		 540 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  51.96 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  52.51 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  53.96 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6256  cobalamin synthesis protein P47K  52.84 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420491  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  50.95 
 
 		 446 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  50.95 
 
 		 446 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  55.2 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  54.14 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  50.95 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  50.95 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  52.49 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  50.86 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  54.14 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  50.95 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  50.71 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  53.63 
 
 		 410 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  53.96 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  54.69 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  52.74 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  51.51 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  52.26 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  52.39 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  52.81 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0399  cobalamin synthesis protein P47K  49.08 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414566  normal  0.973857 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.24 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  51.64 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  48.38 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  49.49 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  47.92 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  48.72 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  47.83 
 
 		 527 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  52.67 
 
 		 377 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  47.7 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>