More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2730 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 420 aa  857    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4084  cobalamin synthesis protein, P47K  64.55 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4282  cobalamin synthesis protein, P47K  64.55 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3235  cobalamin synthesis protein P47K  64.06 
 
 		 420 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6542  cobalamin synthesis protein, P47K  65.06 
 
 		 414 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6256  cobalamin synthesis protein P47K  64.81 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420491  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  57.58 
 
 		 401 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  57.33 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  55.13 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  54.62 
 
 		 401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  53.45 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  54.1 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  53.71 
 
 		 402 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  54.1 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  55.67 
 
 		 400 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  53.47 
 
 		 401 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  55.41 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  50.51 
 
 		 403 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  49.87 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  50.77 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  54.91 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  52.45 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  52.33 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  52.33 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  52.33 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  49.11 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  49.25 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  51.03 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  50.52 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  51.68 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  51.55 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  51.28 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  51.42 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  50.76 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  51.36 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  50.75 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  51.29 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  48.72 
 
 		 401 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  51.38 
 
 		 424 aa  362  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  52.58 
 
 		 406 aa  362  6e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  48.08 
 
 		 401 aa  359  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  49.23 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  48.58 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  49.01 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  49.01 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  49.01 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  49.13 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  48.76 
 
 		 433 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  48.58 
 
 		 399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  48.84 
 
 		 540 aa  352  8e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  49.23 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  47.55 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  46.53 
 
 		 402 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  48.31 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  48.88 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  48.46 
 
 		 410 aa  348  7e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  48.46 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  47.44 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  47.09 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  47.17 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  46.41 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  47.78 
 
 		 403 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  47.69 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  46.93 
 
 		 446 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  46.93 
 
 		 446 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  46.93 
 
 		 446 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  46.93 
 
 		 446 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  50 
 
 		 415 aa  345  7e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  49.23 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  48.3 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  46.68 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  47.87 
 
 		 438 aa  342  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  47.39 
 
 		 519 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  47.87 
 
 		 438 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  47.99 
 
 		 422 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  46.17 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  47.03 
 
 		 416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  46.67 
 
 		 401 aa  338  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  46.41 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  46.41 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  45.62 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0399  cobalamin synthesis protein P47K  46.76 
 
 		 441 aa  335  9e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414566  normal  0.973857 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  46.71 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  44.75 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  43.72 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  43.72 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  46.68 
 
 		 406 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  46.74 
 
 		 393 aa  330  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  44.5 
 
 		 400 aa  328  8e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  45.91 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  45.65 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  46.7 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  47.57 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  43.25 
 
 		 410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  47.21 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  43.31 
 
 		 395 aa  319  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  47.04 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  45.5 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  42.52 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  42.26 
 
 		 395 aa  316  6e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>