More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0421 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  82.32 
 
 
400 aa  679    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
401 aa  807    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  54.43 
 
 
424 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  53.42 
 
 
373 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  44.3 
 
 
395 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  44.82 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  44.04 
 
 
527 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  43.78 
 
 
395 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  44.3 
 
 
395 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  44.04 
 
 
395 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  43.78 
 
 
395 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  43.26 
 
 
395 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  44.62 
 
 
394 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  44.84 
 
 
400 aa  346  4e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  44.47 
 
 
400 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  44.47 
 
 
400 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  46.6 
 
 
376 aa  335  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  45.95 
 
 
399 aa  325  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  47.49 
 
 
373 aa  322  9.000000000000001e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  47.77 
 
 
422 aa  318  9e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  45.82 
 
 
417 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  46.8 
 
 
410 aa  315  6e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0422  cobalamin synthesis protein P47K  42.92 
 
 
442 aa  315  9e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  43.29 
 
 
423 aa  314  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  41.77 
 
 
402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  45.69 
 
 
408 aa  312  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  42.04 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  44.19 
 
 
406 aa  305  9.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  44.53 
 
 
397 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  45.45 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  42.68 
 
 
402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  40.61 
 
 
403 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  45.45 
 
 
435 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2216  cobalamin synthesis protein P47K  42.24 
 
 
448 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  45.82 
 
 
540 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  44.81 
 
 
423 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  42.78 
 
 
400 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  42.57 
 
 
401 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  45.06 
 
 
402 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.17 
 
 
403 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  43.32 
 
 
402 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  44.81 
 
 
423 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  40.76 
 
 
415 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  44.81 
 
 
423 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  43.54 
 
 
400 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.55 
 
 
519 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  42.96 
 
 
401 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  41.53 
 
 
446 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  41.81 
 
 
401 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  44.02 
 
 
423 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  44.7 
 
 
415 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  41.67 
 
 
407 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  41.67 
 
 
402 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  44.83 
 
 
410 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  41.92 
 
 
401 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  41.41 
 
 
402 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  41.4 
 
 
437 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.67 
 
 
446 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  42.17 
 
 
402 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  43.26 
 
 
407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  41.16 
 
 
437 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.43 
 
 
446 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  41.05 
 
 
446 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.43 
 
 
446 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  41.16 
 
 
470 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  41.16 
 
 
437 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  41.25 
 
 
433 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  42.13 
 
 
396 aa  285  9e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.69 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  40.77 
 
 
436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.19 
 
 
446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  43.15 
 
 
406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  40.53 
 
 
436 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  42.04 
 
 
401 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  40.49 
 
 
410 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  43.22 
 
 
397 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  44.11 
 
 
424 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  41.44 
 
 
401 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3235  cobalamin synthesis protein P47K  40.61 
 
 
420 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  40.18 
 
 
442 aa  279  7e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  40.86 
 
 
416 aa  279  8e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  41.28 
 
 
438 aa  279  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  43.11 
 
 
406 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  41.77 
 
 
401 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  44.39 
 
 
410 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  40.18 
 
 
442 aa  276  3e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  40.88 
 
 
438 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  41.25 
 
 
407 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  42.71 
 
 
394 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2715  cobalamin synthesis protein P47K  40.95 
 
 
431 aa  276  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4084  cobalamin synthesis protein, P47K  40.36 
 
 
420 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4282  cobalamin synthesis protein, P47K  40.36 
 
 
420 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  42.42 
 
 
405 aa  275  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.21 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.21 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.75 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6542  cobalamin synthesis protein, P47K  39.95 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321492  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  43.42 
 
 
401 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  39.08 
 
 
441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  41.12 
 
 
403 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>