More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0681 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
373 aa  752    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  68.73 
 
 
373 aa  499  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  62.53 
 
 
376 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  53.42 
 
 
401 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  52.48 
 
 
400 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  47.47 
 
 
410 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  45.01 
 
 
424 aa  314  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  42 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  42 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  40.7 
 
 
395 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  41.43 
 
 
400 aa  298  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  44.25 
 
 
417 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  39.7 
 
 
527 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  39.7 
 
 
395 aa  295  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  41.19 
 
 
394 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  39.45 
 
 
395 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  41.2 
 
 
437 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  39.7 
 
 
395 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  43.22 
 
 
406 aa  294  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  41.99 
 
 
399 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  39.45 
 
 
395 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  39.7 
 
 
395 aa  292  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  43.37 
 
 
408 aa  292  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  38.69 
 
 
395 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  39.95 
 
 
423 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  40.84 
 
 
406 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  40.72 
 
 
436 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  40 
 
 
446 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.67 
 
 
446 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  40 
 
 
446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.67 
 
 
446 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  40.48 
 
 
436 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.44 
 
 
446 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  40.96 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  40.96 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.34 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  40.96 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  41.11 
 
 
433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.29 
 
 
519 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  38.48 
 
 
410 aa  282  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  43.32 
 
 
406 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  43.8 
 
 
410 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  43.7 
 
 
540 aa  276  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  40.29 
 
 
438 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  38.82 
 
 
402 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  40.62 
 
 
402 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  41.73 
 
 
401 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  40.53 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  42.89 
 
 
422 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  41.98 
 
 
415 aa  273  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  41.94 
 
 
401 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  40.66 
 
 
396 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  44.05 
 
 
377 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  40.86 
 
 
407 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  41.44 
 
 
401 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  43.04 
 
 
388 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  41.56 
 
 
423 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  40.53 
 
 
435 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  37.41 
 
 
403 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  42.25 
 
 
393 aa  269  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  40.61 
 
 
397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  40.64 
 
 
402 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  40.62 
 
 
402 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  41.43 
 
 
402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  41.43 
 
 
423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  41.43 
 
 
423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  41.18 
 
 
423 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1955  cobalamin synthesis protein P47K  41.97 
 
 
392 aa  266  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  40.53 
 
 
435 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  38.27 
 
 
415 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.07 
 
 
402 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.26 
 
 
403 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  40.77 
 
 
401 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  40.36 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  40.39 
 
 
397 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6542  cobalamin synthesis protein, P47K  39.1 
 
 
414 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321492  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.5 
 
 
399 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  41.81 
 
 
410 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0399  cobalamin synthesis protein P47K  45.07 
 
 
441 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414566  normal  0.973857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  40.14 
 
 
424 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  36.8 
 
 
420 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  39.85 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6256  cobalamin synthesis protein P47K  38.94 
 
 
414 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420491  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  39.46 
 
 
395 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  40.89 
 
 
405 aa  258  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  41.28 
 
 
406 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  41 
 
 
399 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  39.59 
 
 
401 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4084  cobalamin synthesis protein, P47K  38.63 
 
 
420 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4282  cobalamin synthesis protein, P47K  38.63 
 
 
420 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2715  cobalamin synthesis protein P47K  40.38 
 
 
431 aa  256  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  40.31 
 
 
400 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  40.31 
 
 
400 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  41.23 
 
 
403 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  40.63 
 
 
410 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  40.51 
 
 
408 aa  255  7e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  38.59 
 
 
416 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  39.75 
 
 
404 aa  255  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  41.48 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  40.78 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>