More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2934 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  82.51 
 
 		 406 aa  661    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  98.02 
 
 		 405 aa  803    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  93.35 
 
 		 406 aa  762    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 406 aa  821    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  76.9 
 
 		 406 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  73.86 
 
 		 393 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  68.81 
 
 		 403 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  67 
 
 		 410 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  68.84 
 
 		 404 aa  553  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  69.27 
 
 		 404 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  68.91 
 
 		 401 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  69 
 
 		 401 aa  544  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  67 
 
 		 401 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  67.08 
 
 		 400 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  66.83 
 
 		 403 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  67.08 
 
 		 400 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  69.6 
 
 		 403 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  68.91 
 
 		 410 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  67.41 
 
 		 401 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  67.16 
 
 		 407 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  65.84 
 
 		 403 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  66.08 
 
 		 402 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  66.92 
 
 		 401 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  64.81 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  64.56 
 
 		 407 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  62.87 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.37 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  58.69 
 
 		 406 aa  477  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  60.86 
 
 		 423 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  59.05 
 
 		 416 aa  465  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  60.35 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  56.07 
 
 		 410 aa  458  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  59.9 
 
 		 405 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  59.64 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  60.1 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  53.81 
 
 		 403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  58.19 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  60.35 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  60.35 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  55.33 
 
 		 402 aa  448  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  54.98 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  58.54 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  57.07 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  54.61 
 
 		 415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  54.04 
 
 		 441 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  59 
 
 		 406 aa  438  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  56.82 
 
 		 401 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  58.25 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0399  cobalamin synthesis protein P47K  54.65 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414566  normal  0.973857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  55.69 
 
 		 402 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  55.2 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  55.42 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  55.97 
 
 		 400 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  56.14 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  54.84 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  54.84 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  54.57 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  55.97 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  55.47 
 
 		 401 aa  418  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  54.11 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  54.29 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  54.8 
 
 		 403 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  54.86 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  53.6 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  53.75 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  57.14 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  53.86 
 
 		 436 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  56.65 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  53.25 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  52.9 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  52.78 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  53.75 
 
 		 433 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  53.25 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  53.25 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  56.42 
 
 		 410 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  55.72 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  55.67 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  51.62 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  51.94 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  50.72 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  50.96 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  50.96 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  50.96 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  51.83 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  51.13 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  50.72 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  53.44 
 
 		 397 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  51.83 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  50.72 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  50.62 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  48.38 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  47.49 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  46.97 
 
 		 400 aa  352  5e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  46.97 
 
 		 400 aa  352  5e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  45.45 
 
 		 395 aa  352  8e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  45.98 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  44.39 
 
 		 527 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  44.53 
 
 		 395 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  45.91 
 
 		 395 aa  348  8e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  44.28 
 
 		 395 aa  348  8e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>