More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1061 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1061  cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  48.86 
 
 		 344 aa  207  7e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  46.36 
 
 		 366 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  40.66 
 
 		 428 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  42.42 
 
 		 381 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  33.71 
 
 		 308 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  33.71 
 
 		 308 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2574  cobalamin synthesis protein P47K  33.68 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  33.96 
 
 		 351 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  31.43 
 
 		 360 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  32.67 
 
 		 333 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  36.65 
 
 		 350 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  30.5 
 
 		 460 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  30.5 
 
 		 460 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  33.95 
 
 		 308 aa  91.3  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  31.82 
 
 		 640 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1106  cobalamin synthesis protein P47K  29.1 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  37.74 
 
 		 331 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  30.26 
 
 		 460 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  32.47 
 
 		 345 aa  89.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  32.18 
 
 		 375 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  37.33 
 
 		 327 aa  89.4  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3476  cobalamin synthesis protein P47K  29.28 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  32.18 
 
 		 369 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  32.78 
 
 		 310 aa  89  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  33.77 
 
 		 340 aa  88.6  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  30.69 
 
 		 347 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  36.54 
 
 		 328 aa  88.6  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  28.88 
 
 		 370 aa  89  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  32.65 
 
 		 293 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  32.92 
 
 		 328 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  30.69 
 
 		 353 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  32.68 
 
 		 378 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  31.46 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  30.81 
 
 		 363 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.34 
 
 		 365 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  32.61 
 
 		 353 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  31.61 
 
 		 365 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  31.03 
 
 		 362 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.3 
 
 		 307 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  32.92 
 
 		 307 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.96 
 
 		 305 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.3 
 
 		 307 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  29.56 
 
 		 350 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  31.52 
 
 		 355 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 		 325 aa  85.9  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  32.09 
 
 		 354 aa  85.9  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  35.33 
 
 		 328 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.97 
 
 		 318 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.97 
 
 		 320 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  32.51 
 
 		 347 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.97 
 
 		 307 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  30.34 
 
 		 449 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  30.34 
 
 		 449 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  30.34 
 
 		 449 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  29.67 
 
 		 361 aa  85.1  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.56 
 
 		 345 aa  85.1  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  36.18 
 
 		 324 aa  84.7  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  29.95 
 
 		 349 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  31.49 
 
 		 324 aa  84.7  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  32.47 
 
 		 351 aa  84.7  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  33.97 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  31.68 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  31.28 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.33 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  30.46 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0727  cobalamin synthesis protein P47K  31.65 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  30.46 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  30.54 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  36.67 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  31.41 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  29.47 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  30.54 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  30.54 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0711  cobalamin synthesis protein, P47K  31.65 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  36.67 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  32.91 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  28.57 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  30.54 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2991  cobalamin synthesis protein P47K  30.95 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0647494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  33.77 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  30.26 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  30.26 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  31.82 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.56 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.56 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  28.79 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  33.33 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  33.33 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  33.33 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  33.33 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  33.33 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  33.33 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  32.02 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  30.77 
 
 		 624 aa  82  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 		 367 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>