More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6702 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  100 
 
 		 309 aa  611  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  34.19 
 
 		 364 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  30.38 
 
 		 344 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  30.57 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  35.22 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  33.55 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  33.78 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  30.86 
 
 		 366 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  35.52 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  32.21 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  34.71 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  30.36 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  34 
 
 		 349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.33 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  31.68 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  31.68 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  30.84 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  35.11 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  33.21 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  33.21 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  31.91 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  29.5 
 
 		 349 aa  142  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  32.31 
 
 		 369 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  32.86 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.47 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  38.69 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  30.93 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  32.98 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  33.01 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  27.71 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  42.44 
 
 		 353 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  38.69 
 
 		 363 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  39.13 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0193  cobalamin synthesis protein P47K  35.67 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.9456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  36.68 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  30.54 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  38.54 
 
 		 347 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.44 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  25.5 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.44 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  32.42 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  42.44 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  27.59 
 
 		 362 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  31.25 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  28.8 
 
 		 341 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  41.28 
 
 		 353 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  27.41 
 
 		 346 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  37.19 
 
 		 358 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  27.58 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  39.13 
 
 		 369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  40.98 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  32.47 
 
 		 449 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  37.69 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  32.9 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  28 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  35.74 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  30.59 
 
 		 323 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  39.09 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  27.33 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.04 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  35.23 
 
 		 362 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  28.39 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  28.35 
 
 		 400 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  35.69 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.69 
 
 		 374 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  32.47 
 
 		 449 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  34.07 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  33.47 
 
 		 460 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  34.66 
 
 		 383 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  33.47 
 
 		 460 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  30.5 
 
 		 402 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.28 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.28 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  30.58 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  30.58 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  33.16 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  34.66 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  32.62 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  32.36 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  34.2 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  38.07 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  36.5 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  32.75 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  31.23 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35690  predicted protein  34.64 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.929236  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  32.79 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  32.47 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  33.11 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  31.6 
 
 		 452 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  32.9 
 
 		 457 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  32.64 
 
 		 375 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  32.27 
 
 		 388 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  33.74 
 
 		 493 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  31.01 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 		 367 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  43.79 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  30.26 
 
 		 640 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  34.55 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  43.79 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>