More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1028 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1028  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 322 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.906843  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  48.38 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  43.86 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2976  cobalamin synthesis protein P47K  41.89 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  39.94 
 
 		 364 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5779  cobalamin synthesis protein, P47K  37.9 
 
 		 344 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5604  cobalamin synthesis protein, P47K  40.3 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0283876  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6990  cobalamin synthesis protein P47K  37.18 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5224  cobalamin synthesis protein, P47K  40 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5312  cobalamin synthesis protein, P47K  40 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4158  cobalamin synthesis protein, P47K  37.85 
 
 		 355 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  27.3 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  27.24 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  27.25 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  27.73 
 
 		 384 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 373 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  28.99 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  29.23 
 
 		 380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  27.76 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  27.27 
 
 		 362 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  29.76 
 
 		 366 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  32.91 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  35.33 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.63 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  28.44 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  27.97 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  34.66 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  34.41 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  27.57 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  32.81 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  33.23 
 
 		 323 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  32.63 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  27.83 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.04 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  35.42 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  26.84 
 
 		 378 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  31.18 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  26.84 
 
 		 378 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  27.57 
 
 		 420 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.7 
 
 		 360 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6542  cobalamin synthesis protein, P47K  28.18 
 
 		 414 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  27.61 
 
 		 379 aa  122  8e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  29.97 
 
 		 401 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32.3 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6256  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 414 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420491  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  30.91 
 
 		 422 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  25.89 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  31.68 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  31.68 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  31.13 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  32.6 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  31.58 
 
 		 410 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  31.68 
 
 		 329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  31.48 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  30.61 
 
 		 406 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  32.63 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  31.9 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.23 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  26.32 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  30.64 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  30.2 
 
 		 403 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  29.09 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  30.75 
 
 		 436 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  28.3 
 
 		 402 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  28.97 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  31.23 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.51 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  30.75 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  30.59 
 
 		 417 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 399 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.91 
 
 		 402 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  27.76 
 
 		 338 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  31.13 
 
 		 375 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  31.17 
 
 		 540 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  32.76 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 415 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  30.49 
 
 		 406 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  29.82 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1052  cobalamin synthesis protein, P47K  49.63 
 
 		 191 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  26.72 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  25.94 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  30.69 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  30.67 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  29.67 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  31.69 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  29.14 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  25.67 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  26.46 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  28.12 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  25.07 
 
 		 403 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  30.15 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  30.95 
 
 		 397 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  25.67 
 
 		 395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  27.51 
 
 		 402 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  28.48 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  29.06 
 
 		 416 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  27.97 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  31.09 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  25.4 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  34.14 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>