More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3924 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 344 aa  677    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1028  cobalamin synthesis protein P47K  48.38 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.906843  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  45.66 
 
 		 341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2976  cobalamin synthesis protein P47K  43.23 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  42.38 
 
 		 364 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5779  cobalamin synthesis protein, P47K  36.67 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6990  cobalamin synthesis protein P47K  39.06 
 
 		 360 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5224  cobalamin synthesis protein, P47K  35.45 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5312  cobalamin synthesis protein, P47K  35.45 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5604  cobalamin synthesis protein, P47K  35.45 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0283876  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  37.05 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  31.61 
 
 		 326 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  25.86 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  28.48 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  31.1 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  31.02 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  26.89 
 
 		 342 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  30.49 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  30.49 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  32.42 
 
 		 349 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  29.28 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.84 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.18 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  27.33 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  28.18 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.18 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  28.66 
 
 		 362 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.88 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  35.08 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.58 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.58 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.88 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.58 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  27.88 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  26.45 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  31.42 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  31.05 
 
 		 354 aa  139  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  29.94 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  30.42 
 
 		 320 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  27.84 
 
 		 316 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  30.03 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  30.14 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  26.83 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  26.92 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  31.33 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  29.31 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  31.4 
 
 		 320 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  29.31 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  31.4 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  31.99 
 
 		 322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  29.11 
 
 		 349 aa  135  9e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0193  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.9456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  33.23 
 
 		 364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  27.87 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  28.13 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  30 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  29.29 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  31.38 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  29.06 
 
 		 355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  31 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  28.61 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.86 
 
 		 345 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  29.91 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  31.71 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  28.16 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  33.11 
 
 		 287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.24 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  27.65 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  29.23 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4158  cobalamin synthesis protein, P47K  33.12 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  32.47 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  25.76 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.09 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  27.2 
 
 		 379 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  29.31 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  30.67 
 
 		 332 aa  129  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  37.04 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  27.2 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  27.84 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  32.45 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  30.14 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  29.83 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  27.09 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  30.69 
 
 		 410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  28.49 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  30.03 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  31.79 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  34.78 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  28.23 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  30.15 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.48 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  28.79 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  33.82 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  31.52 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  29.5 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  35.14 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  29.34 
 
 		 436 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  32.25 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  32 
 
 		 337 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  29.43 
 
 		 402 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>