More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5665 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
320 aa  626  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  49.04 
 
 
366 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4765  cobalamin synthesis protein P47K  43.3 
 
 
330 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  38.97 
 
 
318 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  40.21 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  38.46 
 
 
318 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  38.17 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  37.99 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  40.82 
 
 
290 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  36.45 
 
 
336 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6051  cobalamin synthesis protein P47K  37.69 
 
 
330 aa  159  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  34.98 
 
 
364 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  39.54 
 
 
345 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  35.64 
 
 
287 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  37.84 
 
 
349 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  38.12 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 
320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  34.29 
 
 
309 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  37.62 
 
 
379 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  32.54 
 
 
362 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  37.13 
 
 
378 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  37.13 
 
 
378 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.58 
 
 
329 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  37.19 
 
 
353 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  34.89 
 
 
341 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  33.21 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  37.62 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  37.93 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  35.05 
 
 
452 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  33.21 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  32.04 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  39.38 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  36.27 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  36.27 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  35.42 
 
 
449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  32.7 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  34.87 
 
 
449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  34.87 
 
 
449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  32.5 
 
 
324 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  35.23 
 
 
460 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  31.95 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  39.23 
 
 
363 aa  133  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  34.72 
 
 
460 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  30.39 
 
 
323 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  37.06 
 
 
349 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  37.62 
 
 
380 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  36.41 
 
 
457 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  35.91 
 
 
364 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  39.89 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  30.88 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  35.96 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  41.28 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  35.05 
 
 
341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  34.38 
 
 
460 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  37.79 
 
 
383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  39.15 
 
 
349 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  29.71 
 
 
350 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  32.13 
 
 
324 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.34 
 
 
349 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  39.69 
 
 
369 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  38.02 
 
 
393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  38.76 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  32.13 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  31.8 
 
 
404 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  37.79 
 
 
362 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  37.17 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  31.31 
 
 
356 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.74 
 
 
374 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  38.1 
 
 
350 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  38.62 
 
 
361 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  34.18 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  37.79 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.37 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  38.02 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  38.62 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  39.11 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  33.2 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  36.89 
 
 
360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  36.61 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  39.11 
 
 
360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  37.7 
 
 
358 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  38.6 
 
 
377 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.04 
 
 
345 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2976  cobalamin synthesis protein P47K  32.17 
 
 
359 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  37.28 
 
 
323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  37.28 
 
 
323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  39.01 
 
 
354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  35.64 
 
 
364 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  33.78 
 
 
406 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  30.07 
 
 
323 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  27.01 
 
 
327 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  37.57 
 
 
355 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  42.02 
 
 
337 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  34.22 
 
 
313 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  34.65 
 
 
373 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  36.99 
 
 
410 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  39.88 
 
 
369 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.36 
 
 
349 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  37.16 
 
 
540 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  30.79 
 
 
349 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>