More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4765 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4765  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 330 aa  634    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  53.05 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  47.5 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  46.47 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  53.11 
 
 		 366 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  40.48 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  38.84 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  41.94 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  43.32 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  38.49 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  41.34 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  34.48 
 
 		 364 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  35.69 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  33.96 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  33.82 
 
 		 362 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  34.35 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  36.08 
 
 		 336 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  30.23 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  27 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  35.92 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  33.56 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  37.06 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  32.09 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  38.66 
 
 		 379 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  33.71 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  38.66 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6051  cobalamin synthesis protein P47K  35.89 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  30.77 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  32.01 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0294  cobalamin synthesis protein P47K  30.62 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.226941 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  33.68 
 
 		 342 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.85 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  38.02 
 
 		 393 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.89 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  34.01 
 
 		 362 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  28.04 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  32.37 
 
 		 452 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  30.58 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.5 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  30.25 
 
 		 404 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  28.61 
 
 		 380 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  32.78 
 
 		 442 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  36.73 
 
 		 363 aa  123  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  34.8 
 
 		 407 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  32.23 
 
 		 346 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  28.99 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  30.46 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  28.66 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  36.14 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  36.36 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  36.14 
 
 		 360 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  33.69 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  32.44 
 
 		 442 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  31.88 
 
 		 449 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  31.88 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  31.89 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  36.24 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  31.88 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  36.87 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  33.65 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  35.55 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  28.66 
 
 		 366 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  28.62 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  34.94 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  29.02 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  29.02 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  35.14 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  32.83 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  34.42 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  34.93 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  33.65 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.29 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  37.04 
 
 		 460 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  36.71 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.23 
 
 		 350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  30.57 
 
 		 624 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  28.62 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  33.84 
 
 		 379 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  36.07 
 
 		 540 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  30.3 
 
 		 406 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  35.03 
 
 		 364 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  28.14 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  27.46 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  39.76 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  30.72 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  32.79 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  40.83 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.54 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  33.12 
 
 		 410 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  30.03 
 
 		 420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  27.46 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  34.94 
 
 		 460 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  35.41 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  29.35 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  32.44 
 
 		 410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  33.55 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  35.37 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  29.21 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  31.31 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.91 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>