More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4358 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  47.66 
 
 		 336 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  48.56 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6051  cobalamin synthesis protein P47K  46.6 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  49.42 
 
 		 345 aa  225  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  40.75 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  36.9 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  35.51 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4765  cobalamin synthesis protein P47K  40.48 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  45.96 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  36.99 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  36.71 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  39.25 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  35.22 
 
 		 309 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  31.03 
 
 		 349 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  32.81 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  32.92 
 
 		 362 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  32.93 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  34.38 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  33.44 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  41.92 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  31.65 
 
 		 342 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  31.41 
 
 		 344 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  33.89 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  29.5 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  35.37 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  29.7 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  39.8 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  39.8 
 
 		 372 aa  143  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  29.97 
 
 		 362 aa  142  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  35.56 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  38.89 
 
 		 378 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  38.89 
 
 		 378 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  30.41 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  30.41 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  31.23 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  40.1 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  30.03 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  39.09 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  40.1 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  35.9 
 
 		 449 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  38.14 
 
 		 380 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  36.57 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  40.1 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  35.38 
 
 		 449 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  29.38 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  41.12 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  40.5 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  35.75 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  35.75 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  28.01 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  28.01 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  36.36 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  38.64 
 
 		 322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  38.07 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.07 
 
 		 374 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.4 
 
 		 360 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  36.73 
 
 		 362 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  40.1 
 
 		 350 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  31.5 
 
 		 329 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  36.36 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  39 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  39.5 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.19 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  39.09 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  39.18 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  38.69 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  37.44 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  39.29 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  31.73 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  34.18 
 
 		 460 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  34.2 
 
 		 460 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  34.2 
 
 		 460 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  29.51 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  31.21 
 
 		 395 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  37.95 
 
 		 329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  36.36 
 
 		 493 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  38.46 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  38.46 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  34.36 
 
 		 457 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  38.46 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  36.04 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  30.54 
 
 		 395 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  32.11 
 
 		 376 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  38.54 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  36.5 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  30.54 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  39.59 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  32.56 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  37.06 
 
 		 360 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.2 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  33.86 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  30.54 
 
 		 395 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  35.53 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  36.22 
 
 		 357 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  30.2 
 
 		 527 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  38.38 
 
 		 369 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  30.2 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  35.53 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  37.82 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>