More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3251 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  44.95 
 
 
287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  42.97 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  36.9 
 
 
310 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  41.64 
 
 
320 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  35.89 
 
 
336 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  36.49 
 
 
318 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4765  cobalamin synthesis protein P47K  55.84 
 
 
330 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  34.74 
 
 
364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  35.93 
 
 
336 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  36.71 
 
 
349 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  37.59 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  37.2 
 
 
318 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  34.46 
 
 
320 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  31.35 
 
 
362 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  46.58 
 
 
366 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  45.75 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.7 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  44.1 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6051  cobalamin synthesis protein P47K  45.75 
 
 
330 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  36.77 
 
 
449 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  36.77 
 
 
449 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  36.77 
 
 
449 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  36.77 
 
 
452 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  36.54 
 
 
323 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  36.77 
 
 
460 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  36.54 
 
 
323 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  35.71 
 
 
341 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  39.1 
 
 
323 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  40.65 
 
 
353 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  35.03 
 
 
460 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  35.48 
 
 
460 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  37.27 
 
 
355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  38.46 
 
 
323 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  40 
 
 
347 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  39.1 
 
 
350 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  37.42 
 
 
353 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  38.46 
 
 
320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  38.1 
 
 
326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  35.48 
 
 
457 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.71 
 
 
345 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  37.89 
 
 
363 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  39.35 
 
 
349 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  36.51 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  38.71 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  40.25 
 
 
367 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  38.71 
 
 
361 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  42.69 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  37.04 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  39.35 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  40.76 
 
 
360 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  39.35 
 
 
328 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  40.88 
 
 
365 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  39.35 
 
 
328 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  38.71 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  38.71 
 
 
320 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  38.75 
 
 
316 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  38.06 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  31.8 
 
 
298 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  31.66 
 
 
316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  40.13 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  37.66 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  31.61 
 
 
344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  35.4 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.66 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.93 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  31.66 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.93 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  27.04 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.12 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.66 
 
 
316 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  37.58 
 
 
338 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.27 
 
 
316 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  33.23 
 
 
364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  39.35 
 
 
384 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.88 
 
 
316 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  36.48 
 
 
362 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  39.1 
 
 
393 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  36.54 
 
 
332 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  37.66 
 
 
353 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  30.03 
 
 
313 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  39.1 
 
 
343 aa  112  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.1 
 
 
374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  36.13 
 
 
355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  36.48 
 
 
362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  30.03 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  38.61 
 
 
378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  38.61 
 
 
378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  36.77 
 
 
383 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  38.06 
 
 
364 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  34.38 
 
 
327 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  35.85 
 
 
379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  35.85 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1028  cobalamin synthesis protein P47K  32.34 
 
 
322 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.906843  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  35.45 
 
 
375 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  36.54 
 
 
323 aa  108  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  38.27 
 
 
369 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  32.51 
 
 
346 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  38.27 
 
 
360 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>