More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3403 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 341 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  45.66 
 
 		 344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2976  cobalamin synthesis protein P47K  46.97 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1028  cobalamin synthesis protein P47K  43.86 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.906843  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  44.44 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5604  cobalamin synthesis protein, P47K  41.14 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0283876  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5779  cobalamin synthesis protein, P47K  40.69 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5224  cobalamin synthesis protein, P47K  40.84 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5312  cobalamin synthesis protein, P47K  40.84 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6990  cobalamin synthesis protein P47K  38.23 
 
 		 360 aa  185  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4158  cobalamin synthesis protein, P47K  40.64 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  30.38 
 
 		 362 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.86 
 
 		 326 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  30.65 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  31.25 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  29.86 
 
 		 378 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  30.9 
 
 		 378 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  28.86 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  30.85 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  28.05 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  30.18 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  31.03 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  31.85 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.25 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.54 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  28.18 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  33.85 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.33 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  31.63 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.76 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  34.53 
 
 		 349 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.63 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.33 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.02 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  32.83 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.63 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.02 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  31.12 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  36.36 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  32.11 
 
 		 324 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  34.09 
 
 		 388 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  35.87 
 
 		 377 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  29.04 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  29.29 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  36.92 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  33.54 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0193  cobalamin synthesis protein P47K  36.18 
 
 		 320 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.9456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  32.92 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.14 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  31.97 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  31.37 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  29.07 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  34.89 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  31.37 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  29.64 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  34.03 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.02 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  33.02 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  33.02 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  29.79 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  29.64 
 
 		 346 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  29.97 
 
 		 400 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  29.5 
 
 		 349 aa  132  9e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  31.78 
 
 		 360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  31.99 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  33.8 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  31.44 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.95 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  30.95 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.51 
 
 		 345 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  35.69 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  31.68 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  29.63 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  29.33 
 
 		 366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  31.41 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  30.23 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  29.72 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  29.46 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  31.66 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  25.86 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.07 
 
 		 386 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  31.71 
 
 		 350 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  30.31 
 
 		 350 aa  125  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  32.49 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  37.06 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  30.15 
 
 		 323 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  30.43 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.01 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0846  cobalamin synthesis protein P47K  33.12 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.256536  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  29.34 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  31.21 
 
 		 332 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  30.94 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  36.87 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  33.73 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  33.94 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  32.14 
 
 		 408 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  31.73 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  32.21 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  31.28 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>