More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5779 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5779  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 344 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5604  cobalamin synthesis protein, P47K  74.45 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0283876  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5224  cobalamin synthesis protein, P47K  73.99 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5312  cobalamin synthesis protein, P47K  73.99 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6990  cobalamin synthesis protein P47K  55.4 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4158  cobalamin synthesis protein, P47K  52.2 
 
 		 355 aa  299  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1052  cobalamin synthesis protein, P47K  95.14 
 
 		 191 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1051  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  68.37 
 
 		 190 aa  265  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  40.69 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1028  cobalamin synthesis protein P47K  37.9 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.906843  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  39.26 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  36.67 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2976  cobalamin synthesis protein P47K  37.13 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  33.96 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  29.43 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  33.51 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  26.81 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  31.12 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  31.58 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  37.19 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  30.51 
 
 		 313 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  30.29 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  33.45 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  30.86 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  28.46 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  28.91 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  28.91 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  31.54 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  30.64 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  28.82 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  30.74 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  32.04 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  38.54 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  30.99 
 
 		 346 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  30.9 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.37 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  31.77 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  38.46 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  36.76 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  37.91 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  37.84 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  34.42 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  36.76 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  30.39 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  36.68 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  28.57 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  28.7 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  30.09 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  36.9 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  37.36 
 
 		 349 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  37.7 
 
 		 347 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.59 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  35.68 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  35.29 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  28.48 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0580  putative GTP-binding protein YjiA  27.86 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  37.5 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  29.53 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  37.63 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  31.52 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  29.17 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  34.54 
 
 		 460 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  40.54 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  28.64 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  36.81 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  29.24 
 
 		 423 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  36.81 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  28.93 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  38.38 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  36.63 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  33.85 
 
 		 449 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  34.74 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  29.72 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  27.35 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  28.29 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  30.33 
 
 		 424 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  37.84 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  37.84 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  34.21 
 
 		 449 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  35.14 
 
 		 460 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  34.6 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  26.75 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.21 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  24.79 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.19 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  26.69 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  31.16 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.33 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  31.56 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  32.14 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  29.66 
 
 		 423 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  33.81 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  29.66 
 
 		 423 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  29.19 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.19 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  31.31 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  25.4 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  28.18 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.19 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>