More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6990 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6990  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 360 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5779  cobalamin synthesis protein, P47K  55.4 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5224  cobalamin synthesis protein, P47K  59.76 
 
 		 335 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5312  cobalamin synthesis protein, P47K  59.76 
 
 		 335 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5604  cobalamin synthesis protein, P47K  59.76 
 
 		 335 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0283876  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4158  cobalamin synthesis protein, P47K  53.78 
 
 		 355 aa  309  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1052  cobalamin synthesis protein, P47K  71.43 
 
 		 191 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  38.23 
 
 		 341 aa  185  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1028  cobalamin synthesis protein P47K  37.18 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.906843  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  38.26 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  39.06 
 
 		 344 aa  165  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1051  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  41.59 
 
 		 190 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2976  cobalamin synthesis protein P47K  37.91 
 
 		 359 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  37.01 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  32.04 
 
 		 356 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  31.79 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  30.91 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  33.52 
 
 		 349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  33.81 
 
 		 322 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  29.71 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  29.18 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  29.93 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  32.27 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  30.63 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  30.29 
 
 		 401 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  34.29 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  30.89 
 
 		 410 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  28.8 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.21 
 
 		 326 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  29.79 
 
 		 388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  32.57 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6051  cobalamin synthesis protein P47K  36.43 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0846  cobalamin synthesis protein P47K  31.42 
 
 		 449 aa  112  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.256536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  27.08 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.35 
 
 		 360 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  30.9 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  27.11 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.74 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  26.93 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  30.62 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.74 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.11 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  29.11 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  27.39 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  28.24 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  36.06 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  37.24 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  28.31 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  29.55 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.11 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  30.14 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.35 
 
 		 319 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  35.05 
 
 		 353 aa  109  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  26.74 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  32.09 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32.4 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.74 
 
 		 316 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  25.65 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.37 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  31.48 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15320  cobalamin synthesis protein P47K  28.18 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  35.57 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  28.16 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  33.95 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  29.39 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  27.21 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  35.83 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  28.16 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  26.82 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  35.08 
 
 		 349 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  22.77 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  28.09 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  32.85 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  32.12 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  32.75 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  32.85 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  31.94 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  28.88 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  27.92 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  35.42 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  25.92 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  32.34 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  28.45 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  35.94 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  35.42 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  35.35 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  35.94 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  29.02 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  23.5 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  24.11 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  29.02 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  31.37 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  22.19 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  31.25 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  28.42 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  22.74 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  32 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>