More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0757 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  100 
 
 		 366 aa  742    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  49.85 
 
 		 344 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  40.54 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  36.83 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1061  cobalamin biosynthesis protein  46.36 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2574  cobalamin synthesis protein P47K  38.54 
 
 		 208 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3476  cobalamin synthesis protein P47K  31.89 
 
 		 202 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1106  cobalamin synthesis protein P47K  31.77 
 
 		 230 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  38.24 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  37.01 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  36.36 
 
 		 308 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  34.17 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  38.67 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2991  cobalamin synthesis protein P47K  31.71 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0647494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  33.52 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  31.09 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  32.4 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  32.4 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  32.4 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  32.4 
 
 		 337 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  32.96 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  30.18 
 
 		 328 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  32.96 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  35.36 
 
 		 296 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0164  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.54 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  32.96 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  35.36 
 
 		 296 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  32.96 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  32.96 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  32.96 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0298  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.54 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  32.96 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  33.5 
 
 		 325 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  32.58 
 
 		 596 aa  96.7  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  30.39 
 
 		 293 aa  96.3  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  33.85 
 
 		 328 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  29.6 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  37.91 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  34.83 
 
 		 324 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  29.63 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  34.17 
 
 		 460 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  34.17 
 
 		 460 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  32.96 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  31.67 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  31.67 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  33.89 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  32.78 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  32.5 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  36.65 
 
 		 327 aa  94  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  34.43 
 
 		 324 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  31.46 
 
 		 347 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  31.86 
 
 		 325 aa  93.2  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  31.02 
 
 		 308 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.73 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  34.24 
 
 		 460 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.89 
 
 		 374 aa  92.8  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  33.52 
 
 		 367 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.71 
 
 		 316 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  32.42 
 
 		 354 aa  92.8  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  35.71 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  34.46 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  36.32 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  34.78 
 
 		 457 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.73 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  32.96 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  35.11 
 
 		 449 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.22 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  32.08 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  35.64 
 
 		 452 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  33.89 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  29.38 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.22 
 
 		 316 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  33.86 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.22 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1227  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.381423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  30.9 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  32.42 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.22 
 
 		 316 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  35.11 
 
 		 449 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  33.9 
 
 		 640 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  39.2 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  36.22 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  35.11 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  30.9 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  32.08 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  29.81 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  29.81 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 614 aa  90.9  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  30.52 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  31.46 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  29.81 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  31.11 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  35.16 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  34.62 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.7 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  31.98 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0421  hypothetical protein  29.03 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>