More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1285 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 316 aa  635    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1227  cobalamin synthesis protein P47K  39.32 
 
 		 341 aa  261  6.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.381423 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  29.67 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  29.33 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0421  hypothetical protein  28.43 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  31.01 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  27.41 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  34.67 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  34.39 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  28.49 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  30.45 
 
 		 381 aa  99.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1106  cobalamin synthesis protein P47K  34.59 
 
 		 230 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  23.35 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  30.26 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  32.6 
 
 		 428 aa  96.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  27.27 
 
 		 347 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  25.49 
 
 		 298 aa  95.9  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  25.16 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  25 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  28.07 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  25.08 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  22.78 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  30.52 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  24.21 
 
 		 369 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  31.88 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  22.04 
 
 		 322 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  25.11 
 
 		 378 aa  89.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  25.53 
 
 		 325 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  24.08 
 
 		 375 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  23.89 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2574  cobalamin synthesis protein P47K  31.52 
 
 		 208 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  36.05 
 
 		 338 aa  85.9  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  25.61 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  30.43 
 
 		 347 aa  86.3  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  23.24 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  33.75 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  28.22 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.54 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  33.99 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.35 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  25.53 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  34.68 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  29.05 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  26.38 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  27.65 
 
 		 625 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  34.46 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  24.09 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  28.57 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  34.46 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26190  predicted GTPase, G3E family  26.24 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  23.05 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  38.17 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  23.87 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  26.65 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  36.72 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  23.24 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  33.73 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  28.74 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  25.53 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  22.78 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  35.94 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  31.25 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  24.23 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  24.65 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  29.45 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  28.22 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  30.53 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  24.23 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  30.41 
 
 		 648 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  31.87 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1723  cobalamin synthesis protein P47K  22.04 
 
 		 615 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  41.58 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  29.26 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  30.4 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  23.32 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  23.85 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  22.97 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  31.48 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  39.6 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15320  cobalamin synthesis protein P47K  24.75 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  25.7 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.46 
 
 		 344 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  30.25 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  30.25 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  27.19 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  29.23 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  32.76 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  33.61 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  23.35 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  34.62 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  33.61 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  41.24 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  28.12 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  23.05 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  29.57 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  33.61 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  23.15 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  26.95 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1061  cobalamin biosynthesis protein  26.49 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>