More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1723 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1723  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
615 aa  1246    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  28.64 
 
 
614 aa  221  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  31.57 
 
 
648 aa  217  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  25.76 
 
 
596 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  29.19 
 
 
624 aa  213  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  28.46 
 
 
625 aa  190  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  26.18 
 
 
640 aa  188  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  34.03 
 
 
345 aa  120  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  32.62 
 
 
332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.53 
 
 
320 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.91 
 
 
320 aa  113  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  29.91 
 
 
342 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  26.55 
 
 
310 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.36 
 
 
320 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  28.92 
 
 
344 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  29.65 
 
 
324 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.7 
 
 
319 aa  107  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.7 
 
 
316 aa  107  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  30.84 
 
 
350 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  37 
 
 
379 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  37 
 
 
372 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  29.79 
 
 
316 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  29.75 
 
 
316 aa  104  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  37.43 
 
 
349 aa  104  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.57 
 
 
316 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.75 
 
 
316 aa  104  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.7 
 
 
307 aa  104  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.09 
 
 
316 aa  104  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  30.3 
 
 
339 aa  103  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  30.53 
 
 
352 aa  103  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.41 
 
 
335 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.45 
 
 
316 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.35 
 
 
307 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.45 
 
 
316 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  29.48 
 
 
319 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  31.38 
 
 
351 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  29.91 
 
 
319 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  29.51 
 
 
423 aa  101  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  36.98 
 
 
380 aa  101  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  32.43 
 
 
328 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  30.06 
 
 
325 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  29.11 
 
 
349 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  31.69 
 
 
323 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  30.97 
 
 
345 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  28.92 
 
 
323 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  30.53 
 
 
403 aa  99.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  30.38 
 
 
393 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  30.03 
 
 
406 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  24.43 
 
 
308 aa  99  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  29.43 
 
 
323 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  27.89 
 
 
328 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  29.18 
 
 
402 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  29.43 
 
 
323 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.36 
 
 
406 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  30.36 
 
 
406 aa  99.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  31.38 
 
 
337 aa  99.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  29.18 
 
 
423 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  29.18 
 
 
423 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  28.87 
 
 
323 aa  98.2  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0962  putative GTP-binding protein YjiA  31.69 
 
 
322 aa  98.6  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.177818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  29.14 
 
 
323 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  32.18 
 
 
338 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  31.89 
 
 
328 aa  98.6  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  29.02 
 
 
402 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  29.08 
 
 
323 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  27.33 
 
 
394 aa  98.2  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  29.02 
 
 
402 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  31.68 
 
 
325 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.76 
 
 
325 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  29.02 
 
 
402 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.83 
 
 
320 aa  97.4  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  30.32 
 
 
335 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  29.46 
 
 
404 aa  97.4  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  29.41 
 
 
400 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  34.1 
 
 
366 aa  97.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  37.43 
 
 
346 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  32.04 
 
 
329 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.18 
 
 
307 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  35.57 
 
 
353 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  37.43 
 
 
346 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.18 
 
 
307 aa  97.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  28.62 
 
 
423 aa  96.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  34.15 
 
 
372 aa  96.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  29.32 
 
 
394 aa  96.3  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  34.15 
 
 
369 aa  96.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  31.13 
 
 
325 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  29.55 
 
 
364 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  30.5 
 
 
323 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  36.6 
 
 
350 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  40.35 
 
 
364 aa  95.9  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  29.17 
 
 
441 aa  95.9  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  25.18 
 
 
328 aa  95.9  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  37.84 
 
 
379 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  29.76 
 
 
349 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  27.78 
 
 
401 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  29.05 
 
 
420 aa  95.9  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  31.69 
 
 
320 aa  95.9  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  25.24 
 
 
400 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  24.82 
 
 
307 aa  95.1  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  24.82 
 
 
307 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>