More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2933 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  100 
 
 
350 aa  693    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  76.09 
 
 
344 aa  515  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  75.51 
 
 
344 aa  491  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  77.49 
 
 
350 aa  455  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  71.09 
 
 
345 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  72.27 
 
 
345 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  72.19 
 
 
345 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  62.76 
 
 
343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  57.02 
 
 
348 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.87 
 
 
349 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  55.59 
 
 
345 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.73 
 
 
349 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.76 
 
 
349 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.76 
 
 
349 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.53 
 
 
344 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.32 
 
 
344 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.85 
 
 
349 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  53.85 
 
 
349 aa  352  4e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.4 
 
 
344 aa  352  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.21 
 
 
357 aa  348  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  57.14 
 
 
344 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  57.14 
 
 
344 aa  346  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.41 
 
 
344 aa  341  9e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.71 
 
 
344 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  50 
 
 
354 aa  338  8e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.31 
 
 
359 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  54.84 
 
 
350 aa  316  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  49.24 
 
 
348 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.89 
 
 
349 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.95 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.75 
 
 
355 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  50.43 
 
 
375 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.03 
 
 
355 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.34 
 
 
358 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.86 
 
 
350 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.47 
 
 
355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.2 
 
 
386 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.44 
 
 
349 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.67 
 
 
357 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.67 
 
 
357 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  46.38 
 
 
357 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.38 
 
 
357 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.38 
 
 
357 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.38 
 
 
357 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  48.18 
 
 
354 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.11 
 
 
363 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  48.04 
 
 
357 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.38 
 
 
390 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.83 
 
 
343 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  48.54 
 
 
354 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  48.84 
 
 
346 aa  292  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.48 
 
 
343 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.69 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  46.38 
 
 
367 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.08 
 
 
334 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.51 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.12 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  43.9 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  47.63 
 
 
335 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  47.38 
 
 
335 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  46.24 
 
 
362 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.24 
 
 
362 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.24 
 
 
362 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  46.24 
 
 
362 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.42 
 
 
362 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.19 
 
 
360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.13 
 
 
362 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.56 
 
 
369 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  43.3 
 
 
369 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  40.69 
 
 
344 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  42.61 
 
 
369 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  39.57 
 
 
351 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  36.64 
 
 
364 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  34.01 
 
 
354 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  39.37 
 
 
371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  37.88 
 
 
381 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  35.14 
 
 
354 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  34.53 
 
 
354 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  35.33 
 
 
350 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.52 
 
 
320 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  32.42 
 
 
347 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.71 
 
 
323 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  32.25 
 
 
323 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  32.25 
 
 
323 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  33.14 
 
 
323 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.46 
 
 
323 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  33.24 
 
 
343 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 
323 aa  153  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03750  hypothetical protein  31.67 
 
 
367 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.32469  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  31.78 
 
 
360 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.1 
 
 
320 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.93 
 
 
320 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  31.64 
 
 
335 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  30.89 
 
 
375 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  31.96 
 
 
404 aa  149  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  32.76 
 
 
327 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  31.23 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  31.95 
 
 
360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  32.1 
 
 
325 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.98 
 
 
374 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>