More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26190 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26190  predicted GTPase, G3E family  100 
 
 		 329 aa  674    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  29.21 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  26.88 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  26.78 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  27.22 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  27.22 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  25.57 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  31.44 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  29.6 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  30.47 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.87 
 
 		 386 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.21 
 
 		 349 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.72 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  26.85 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  26.85 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  26.61 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  31.23 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0421  hypothetical protein  25.71 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  26.26 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  31.21 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.9 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  26.73 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  28.97 
 
 		 322 aa  96.3  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  31.79 
 
 		 428 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  31.64 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.35 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.69 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.69 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.69 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  27.3 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.4 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.4 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.4 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  26.8 
 
 		 640 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.4 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  23.6 
 
 		 340 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.4 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.69 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.42 
 
 		 390 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10480  CobW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07990)  25.85 
 
 		 409 aa  92.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0306416  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  27.38 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  26.73 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.91 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  35.29 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1106  cobalamin synthesis protein P47K  28.11 
 
 		 230 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  30 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.08 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  27.38 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.44 
 
 		 344 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 332 aa  89.4  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.61 
 
 		 307 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  25.08 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  27.98 
 
 		 354 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  27.46 
 
 		 298 aa  89.4  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  31.47 
 
 		 408 aa  89.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  27.98 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.17 
 
 		 390 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  27.96 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  26.61 
 
 		 614 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  33.51 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.44 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  32.79 
 
 		 382 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  39.6 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  32.39 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  31.41 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  27.64 
 
 		 336 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  24.65 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  32.97 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  28.1 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  30.37 
 
 		 383 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.75 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  28.62 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  31.18 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  31.79 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  39.05 
 
 		 351 aa  86.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  28.35 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.72 
 
 		 344 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  30.29 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.16 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  24.23 
 
 		 362 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  35.25 
 
 		 395 aa  85.9  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  27.09 
 
 		 320 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.17 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  27.53 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  26.99 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  30.59 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  27.7 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  30.6 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  28.02 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  27.13 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  30.14 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  31.4 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  27.81 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  29.59 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.58 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  30.68 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  32.28 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  27.81 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.23 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>