35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3004 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3004  Protein of unknown function DUF1980  100 
 
 
250 aa  518  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2882  G3E family GTPase-like protein  36 
 
 
318 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000684528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0583  hypothetical protein  29.15 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0048  Protein of unknown function DUF1980  26.74 
 
 
287 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161282  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0015  hypothetical protein  23.2 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000410409 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0713  hypothetical protein  23.17 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.102168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1541  hypothetical protein  20.3 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00136912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3267  hypothetical protein  22.22 
 
 
289 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251894  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2647  Protein of unknown function DUF1980  20.5 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2042  hypothetical protein  23.08 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1902  hypothetical protein  22.22 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00948912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1519  Protein of unknown function DUF1980  17.14 
 
 
281 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0728  hypothetical protein  20.88 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2121  hypothetical protein  21.37 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.768081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2085  hypothetical protein  19.66 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2153  hypothetical protein  21.37 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0358578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2052  hypothetical protein  19.66 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1905  hypothetical protein  19.66 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.060898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1858  hypothetical protein  21.37 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000233992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1868  hypothetical protein  19.66 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000275781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1141  hypothetical protein  22.22 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0465994  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0337  Protein of unknown function DUF1980  24.37 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1601  hypothetical protein  22.77 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1778  hypothetical protein  16.36 
 
 
294 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1634  hypothetical protein  18.48 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1763  hypothetical protein  18.48 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1260  hypothetical protein  24.11 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1695  membrane protein-like  19.17 
 
 
232 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1612  permease  19.57 
 
 
290 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1813  hypothetical protein  18.48 
 
 
290 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4807  hypothetical protein  27.75 
 
 
259 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3566  hypothetical protein  17.27 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.509329  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1480  Protein of unknown function DUF1980  23.38 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29311  hypothetical protein  23.53 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0435  hypothetical protein  24.14 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.267634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>