38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0435 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0435  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.267634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4807  hypothetical protein  51.02 
 
 
259 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3209  hypothetical protein  50 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.673571  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1141  hypothetical protein  49.58 
 
 
252 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0465994  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1480  Protein of unknown function DUF1980  43.36 
 
 
272 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4945  hypothetical protein  46.42 
 
 
273 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3808  hypothetical protein  41.34 
 
 
268 aa  201  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29311  hypothetical protein  30.51 
 
 
217 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1360  hypothetical protein  34.15 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.944769  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1601  hypothetical protein  29.22 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1695  membrane protein-like  25 
 
 
232 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1778  hypothetical protein  24.29 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1838  hypothetical protein  21.46 
 
 
293 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.968121  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1813  hypothetical protein  25 
 
 
290 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1763  hypothetical protein  24.32 
 
 
290 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0337  Protein of unknown function DUF1980  32.35 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1634  hypothetical protein  24.32 
 
 
290 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1612  permease  24.32 
 
 
290 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3566  hypothetical protein  21.58 
 
 
294 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.509329  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3200  hypothetical protein  30.53 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000205727  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0713  hypothetical protein  24.73 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.102168  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0583  hypothetical protein  23.58 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0728  hypothetical protein  24.26 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1260  hypothetical protein  28.48 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1858  hypothetical protein  23.81 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000233992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2153  hypothetical protein  23.81 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0358578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2121  hypothetical protein  23.81 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.768081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1868  hypothetical protein  23.68 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000275781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2052  hypothetical protein  23.68 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2085  hypothetical protein  23.68 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3267  hypothetical protein  22.62 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251894  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2042  hypothetical protein  23.81 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1905  hypothetical protein  23.68 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.060898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3004  Protein of unknown function DUF1980  24.14 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1860  membrane protein-like protein  31.43 
 
 
326 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0186  membrane protein-like protein  28.57 
 
 
304 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0048  Protein of unknown function DUF1980  28 
 
 
287 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1519  Protein of unknown function DUF1980  29.58 
 
 
281 aa  42  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>