13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1360 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1360  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  425  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.944769  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29311  hypothetical protein  67.74 
 
 
217 aa  285  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1601  hypothetical protein  69.65 
 
 
217 aa  281  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4807  hypothetical protein  29.71 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1141  hypothetical protein  30.3 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0465994  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3808  hypothetical protein  27.35 
 
 
268 aa  85.9  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0435  hypothetical protein  34.18 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.267634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1480  Protein of unknown function DUF1980  29.03 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4945  hypothetical protein  34.25 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3209  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  71.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.673571  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1860  membrane protein-like protein  35.34 
 
 
326 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1695  membrane protein-like  31.71 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1260  hypothetical protein  25.49 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>