23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1601 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1601  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1360  hypothetical protein  68.2 
 
 
217 aa  281  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.944769  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29311  hypothetical protein  64.98 
 
 
217 aa  276  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4807  hypothetical protein  28.69 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3808  hypothetical protein  31.2 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0435  hypothetical protein  28.77 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.267634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1141  hypothetical protein  27.08 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0465994  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3209  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.673571  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1480  Protein of unknown function DUF1980  28.34 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1695  membrane protein-like  26.88 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4945  hypothetical protein  31.85 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0583  hypothetical protein  32.95 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3200  hypothetical protein  29.52 
 
 
274 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000205727  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1260  hypothetical protein  28.05 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1860  membrane protein-like protein  30.43 
 
 
326 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3004  Protein of unknown function DUF1980  22.77 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0048  Protein of unknown function DUF1980  27.27 
 
 
287 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2852  hypothetical protein  26.32 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2647  Protein of unknown function DUF1980  23.6 
 
 
282 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3566  hypothetical protein  27.17 
 
 
294 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.509329  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0186  membrane protein-like protein  25.42 
 
 
304 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3267  hypothetical protein  26.53 
 
 
289 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251894  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1902  hypothetical protein  26.53 
 
 
289 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00948912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>