28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2852 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2852  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0186  membrane protein-like protein  37.62 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1260  hypothetical protein  36.73 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2795  hypothetical protein  38.35 
 
 		 255 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.400114  normal  0.154233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1874  hypothetical protein  35.98 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2657  hypothetical protein  35.19 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000346447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5331  hypothetical protein  29.28 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1860  membrane protein-like protein  30.4 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1519  Protein of unknown function DUF1980  21.9 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3209  hypothetical protein  28.24 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.673571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4807  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  52.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3566  hypothetical protein  24.49 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.509329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1480  Protein of unknown function DUF1980  28 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1778  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1813  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1763  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1612  permease  25 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1634  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0337  Protein of unknown function DUF1980  27.36 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1838  hypothetical protein  23.47 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.968121  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1601  hypothetical protein  26.6 
 
 		 217 aa  45.8  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2647  Protein of unknown function DUF1980  21.24 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0048  Protein of unknown function DUF1980  23.62 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161282  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4252  hypothetical protein  27.12 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0626578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2042  hypothetical protein  29 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2153  hypothetical protein  28 
 
 		 289 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0358578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1858  hypothetical protein  28 
 
 		 289 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000233992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2121  hypothetical protein  28 
 
 		 289 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.768081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>