40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0583 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0583  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  520  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0048  Protein of unknown function DUF1980  35.38 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3004  Protein of unknown function DUF1980  29.52 
 
 
250 aa  89.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0015  hypothetical protein  26.43 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000410409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1695  membrane protein-like  24.02 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1778  hypothetical protein  25.37 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0337  Protein of unknown function DUF1980  32.5 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1634  hypothetical protein  23.86 
 
 
290 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1763  hypothetical protein  23.86 
 
 
290 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3566  hypothetical protein  22.18 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.509329  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1612  permease  23.86 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1813  hypothetical protein  23.86 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1141  hypothetical protein  25.99 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0465994  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2647  Protein of unknown function DUF1980  25.8 
 
 
282 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3209  hypothetical protein  31.73 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.673571  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0435  hypothetical protein  23.81 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.267634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3808  hypothetical protein  32.08 
 
 
268 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1838  hypothetical protein  24.14 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.968121  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4807  hypothetical protein  29.81 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1601  hypothetical protein  32.95 
 
 
217 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1868  hypothetical protein  24.3 
 
 
289 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000275781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1519  Protein of unknown function DUF1980  22.14 
 
 
281 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2052  hypothetical protein  23.83 
 
 
289 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1905  hypothetical protein  23.83 
 
 
289 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.060898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2085  hypothetical protein  23.83 
 
 
289 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1541  hypothetical protein  22.64 
 
 
289 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00136912  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0046  hypothetical protein  25 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0045  hypothetical protein  24.4 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2121  hypothetical protein  25.94 
 
 
289 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.768081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2153  hypothetical protein  25.94 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0358578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1858  hypothetical protein  25.94 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000233992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3267  hypothetical protein  25.47 
 
 
289 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251894  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0713  hypothetical protein  22.47 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.102168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1902  hypothetical protein  24.53 
 
 
289 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00948912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2042  hypothetical protein  25 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29311  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0728  hypothetical protein  22.1 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4945  hypothetical protein  26.56 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1260  hypothetical protein  27.27 
 
 
247 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2882  G3E family GTPase-like protein  26.67 
 
 
318 aa  42  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000684528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>