19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0045 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0045  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0046  hypothetical protein  98.33 
 
 		 239 aa  471  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142914  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0583  hypothetical protein  23.04 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1519  Protein of unknown function DUF1980  25.35 
 
 		 281 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0048  Protein of unknown function DUF1980  19.43 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1838  hypothetical protein  17.72 
 
 		 293 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.968121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0728  hypothetical protein  26.32 
 
 		 270 aa  45.1  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0713  hypothetical protein  27.55 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.102168  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0015  hypothetical protein  18.35 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000410409 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1763  hypothetical protein  16.86 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1612  permease  16.86 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1634  hypothetical protein  16.86 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1813  hypothetical protein  16.86 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0337  Protein of unknown function DUF1980  23.44 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1868  hypothetical protein  22.83 
 
 		 289 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000275781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2052  hypothetical protein  22.83 
 
 		 289 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1905  hypothetical protein  22.83 
 
 		 289 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.060898  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2882  G3E family GTPase-like protein  36.17 
 
 		 318 aa  42  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000684528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2085  hypothetical protein  22.83 
 
 		 289 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>