29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0015 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0015  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  532  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000410409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0048  Protein of unknown function DUF1980  33.33 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3004  Protein of unknown function DUF1980  24.76 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0583  hypothetical protein  26.43 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1778  hypothetical protein  20.58 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1634  hypothetical protein  21.4 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1612  permease  21.4 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1763  hypothetical protein  21.4 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1813  hypothetical protein  21.4 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3566  hypothetical protein  20.48 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.509329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0337  Protein of unknown function DUF1980  31.76 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1838  hypothetical protein  19.01 
 
 		 293 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.968121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1695  membrane protein-like  22.77 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5331  hypothetical protein  25.66 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1902  hypothetical protein  24.42 
 
 		 289 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00948912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1519  Protein of unknown function DUF1980  25 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2882  G3E family GTPase-like protein  21.98 
 
 		 318 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000684528  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1480  Protein of unknown function DUF1980  20.54 
 
 		 272 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3267  hypothetical protein  23.26 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1541  hypothetical protein  23.91 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00136912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1868  hypothetical protein  19.69 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000275781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2042  hypothetical protein  23.26 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2052  hypothetical protein  20.93 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2085  hypothetical protein  20.93 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1905  hypothetical protein  20.93 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.060898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2121  hypothetical protein  23.26 
 
 		 289 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.768081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1858  hypothetical protein  23.26 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000233992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2153  hypothetical protein  23.26 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0358578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2647  Protein of unknown function DUF1980  23.91 
 
 		 282 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>