138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0043 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0043  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  387  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0044  hypothetical protein  97.94 
 
 
194 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2882  G3E family GTPase-like protein  31.21 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000684528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  32.76 
 
 
524 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  25.99 
 
 
308 aa  61.6  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  25.42 
 
 
308 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  24.6 
 
 
364 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  27.89 
 
 
341 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  25.15 
 
 
333 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  25.28 
 
 
293 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  25 
 
 
423 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  21.33 
 
 
388 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  22.75 
 
 
399 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  24.32 
 
 
337 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  25.71 
 
 
344 aa  50.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  22.12 
 
 
397 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  24.53 
 
 
395 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  25.57 
 
 
331 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  23.12 
 
 
358 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  21.8 
 
 
420 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0711  cobalamin synthesis protein, P47K  25.88 
 
 
308 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0727  cobalamin synthesis protein P47K  25.88 
 
 
308 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  25.35 
 
 
406 aa  48.9  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  24.34 
 
 
357 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  24.87 
 
 
339 aa  48.9  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  23.68 
 
 
347 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4084  cobalamin synthesis protein, P47K  22.43 
 
 
420 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  25.54 
 
 
362 aa  48.9  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4282  cobalamin synthesis protein, P47K  22.43 
 
 
420 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  22.54 
 
 
406 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  30.25 
 
 
524 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  20.74 
 
 
382 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  25.41 
 
 
324 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  21.55 
 
 
313 aa  48.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  26.06 
 
 
324 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  24.58 
 
 
380 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  20.87 
 
 
408 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1227  cobalamin synthesis protein P47K  21.71 
 
 
341 aa  47.4  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.381423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  25.56 
 
 
360 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  20.57 
 
 
408 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  24.06 
 
 
395 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  21.58 
 
 
360 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0339  hypothetical protein  29.09 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  23.58 
 
 
395 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  24.06 
 
 
395 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  26.92 
 
 
378 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  25.47 
 
 
296 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  25.47 
 
 
296 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6256  cobalamin synthesis protein P47K  22.12 
 
 
414 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420491  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  24.54 
 
 
322 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  26.92 
 
 
378 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  24.73 
 
 
460 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  21.9 
 
 
417 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  22.22 
 
 
415 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3235  cobalamin synthesis protein P47K  22.9 
 
 
420 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  24.06 
 
 
527 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  19.69 
 
 
395 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  21.94 
 
 
377 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  18.96 
 
 
377 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  24.86 
 
 
460 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6542  cobalamin synthesis protein, P47K  21.63 
 
 
414 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321492  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  24.37 
 
 
346 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  22.32 
 
 
433 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  21.55 
 
 
322 aa  45.1  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  25.53 
 
 
449 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  25.67 
 
 
449 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  23.58 
 
 
363 aa  45.1  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  22.37 
 
 
406 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  22.34 
 
 
640 aa  44.7  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  25.67 
 
 
449 aa  44.7  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  21.95 
 
 
308 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  23.11 
 
 
395 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  21.66 
 
 
394 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  19.56 
 
 
352 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  26.06 
 
 
452 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  24.73 
 
 
457 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  21.39 
 
 
395 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  19.9 
 
 
356 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  24.73 
 
 
460 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  23.03 
 
 
614 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  18.69 
 
 
355 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  23.11 
 
 
395 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  22.64 
 
 
395 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  23.66 
 
 
344 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  18.18 
 
 
357 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  25.13 
 
 
624 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  19.02 
 
 
410 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  24.18 
 
 
369 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  24.18 
 
 
372 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  21.23 
 
 
401 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  20.38 
 
 
405 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  23.78 
 
 
346 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  22.17 
 
 
358 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  23.78 
 
 
346 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  20.28 
 
 
400 aa  42.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2574  cobalamin synthesis protein P47K  23.83 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  22.33 
 
 
437 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  23.83 
 
 
362 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.58 
 
 
399 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  20.37 
 
 
395 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>