244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0306 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
613 aa  1253    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  39.62 
 
 
537 aa  226  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  28.89 
 
 
519 aa  207  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  26.47 
 
 
583 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  35.56 
 
 
480 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  35.69 
 
 
525 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  35.38 
 
 
568 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 
637 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  30.85 
 
 
489 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0305  flagellar hook-associated protein FlgK  23.92 
 
 
620 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  35.63 
 
 
708 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  23.56 
 
 
627 aa  140  7.999999999999999e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  29.33 
 
 
838 aa  139  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  32.91 
 
 
531 aa  134  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  34.9 
 
 
486 aa  131  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  34.87 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  31.38 
 
 
541 aa  127  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  30.53 
 
 
858 aa  127  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  34.51 
 
 
715 aa  124  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  33.12 
 
 
570 aa  124  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  25.18 
 
 
680 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  28.01 
 
 
846 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  33.48 
 
 
471 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  23.44 
 
 
477 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  31.45 
 
 
696 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  25.04 
 
 
623 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  28.06 
 
 
847 aa  113  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 
586 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  26.38 
 
 
858 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  26.38 
 
 
858 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  33.2 
 
 
680 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 
623 aa  108  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.52 
 
 
685 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  30.16 
 
 
478 aa  108  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  30.69 
 
 
647 aa  107  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  31.6 
 
 
477 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0566  flagellar hook-associated protein FlgK  28.35 
 
 
628 aa  107  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  24.27 
 
 
631 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  23.6 
 
 
554 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  23.6 
 
 
554 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  29.82 
 
 
695 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  23.6 
 
 
554 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  23.28 
 
 
609 aa  101  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  30.22 
 
 
532 aa  101  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  29.92 
 
 
697 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  29.45 
 
 
617 aa  99.8  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  28.76 
 
 
463 aa  99.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  30.42 
 
 
623 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  32.68 
 
 
458 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  28.21 
 
 
614 aa  98.2  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  29.64 
 
 
638 aa  97.4  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  31.4 
 
 
629 aa  97.1  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  32.3 
 
 
458 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  23.24 
 
 
548 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  27.67 
 
 
653 aa  95.9  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  26.88 
 
 
623 aa  95.9  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  29.02 
 
 
453 aa  94  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  29.53 
 
 
698 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  27.36 
 
 
818 aa  93.2  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  30.92 
 
 
645 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  26.74 
 
 
672 aa  92.8  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  30.92 
 
 
645 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 
682 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1783  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 
624 aa  92  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 
482 aa  92  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  27.52 
 
 
463 aa  91.7  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  26.92 
 
 
691 aa  91.3  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004164  flagellar hook-associated protein FlgK  29 
 
 
646 aa  90.1  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  25.66 
 
 
920 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  28.64 
 
 
642 aa  90.1  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  27.93 
 
 
665 aa  89  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  28.35 
 
 
453 aa  89.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  28.67 
 
 
465 aa  88.6  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  26.33 
 
 
475 aa  89  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  27.12 
 
 
658 aa  88.2  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  27.83 
 
 
458 aa  88.2  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  29.89 
 
 
541 aa  88.2  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  30.56 
 
 
454 aa  87.8  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  30.1 
 
 
644 aa  87.4  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2329  flagellar hook-associated protein FlgK  25.83 
 
 
626 aa  87.4  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  29.77 
 
 
640 aa  87  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  27.59 
 
 
642 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  27.73 
 
 
457 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  26.06 
 
 
459 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01297  flagellar hook-associated protein FlgK  27.36 
 
 
637 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  27.97 
 
 
623 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  28.74 
 
 
702 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  28.96 
 
 
630 aa  85.9  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  26.51 
 
 
645 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  26.65 
 
 
608 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  28.74 
 
 
660 aa  85.1  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  22.83 
 
 
566 aa  85.5  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1459  flagellar hook-associated protein FlgK  27.5 
 
 
608 aa  84.7  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  28.09 
 
 
637 aa  84.7  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 
690 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
652 aa  84.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  29.5 
 
 
658 aa  84.7  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 
641 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  24.81 
 
 
641 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  27 
 
 
686 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>