257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0095 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
537 aa  1102    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  57.12 
 
 
519 aa  599  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  37.74 
 
 
525 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  39.04 
 
 
480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  30.15 
 
 
471 aa  234  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  31.27 
 
 
486 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  39.62 
 
 
613 aa  226  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 
541 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  31.57 
 
 
531 aa  220  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  28.15 
 
 
489 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  32.09 
 
 
838 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  34.51 
 
 
708 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  35.56 
 
 
568 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  30.42 
 
 
637 aa  162  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  28.04 
 
 
482 aa  160  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  30.59 
 
 
858 aa  156  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  34.47 
 
 
858 aa  156  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  30.59 
 
 
858 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  28.65 
 
 
478 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  25.19 
 
 
475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  30.28 
 
 
570 aa  149  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  28.92 
 
 
465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  28.55 
 
 
477 aa  145  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  30.48 
 
 
443 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  26.34 
 
 
459 aa  143  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  34.96 
 
 
583 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  27.12 
 
 
847 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.49 
 
 
477 aa  136  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  25.82 
 
 
546 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  25.6 
 
 
846 aa  135  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 
818 aa  134  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  33.04 
 
 
586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  24.81 
 
 
464 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  26.07 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  37.62 
 
 
642 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  23.19 
 
 
464 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  24.62 
 
 
458 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  26.59 
 
 
547 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.25 
 
 
547 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  26.32 
 
 
627 aa  122  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  26.59 
 
 
547 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  26.41 
 
 
547 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  26.59 
 
 
547 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  26.59 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  25.55 
 
 
466 aa  120  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  27.81 
 
 
623 aa  119  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  31.27 
 
 
680 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  32.83 
 
 
645 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  24.48 
 
 
455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  32.83 
 
 
645 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  32.29 
 
 
532 aa  118  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  31.54 
 
 
631 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  35.19 
 
 
638 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
680 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
682 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  29.36 
 
 
617 aa  115  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  29.05 
 
 
682 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  28.84 
 
 
623 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  31.21 
 
 
637 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0305  flagellar hook-associated protein FlgK  30.86 
 
 
620 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  25.23 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  24.31 
 
 
560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  34.6 
 
 
631 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  30.33 
 
 
683 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0708  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 
623 aa  110  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00565259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  24.38 
 
 
469 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  28.43 
 
 
686 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  28.96 
 
 
920 aa  110  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  25.93 
 
 
463 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  31.21 
 
 
683 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  30.54 
 
 
647 aa  107  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  29.58 
 
 
614 aa  107  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  29.87 
 
 
681 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  26.8 
 
 
609 aa  107  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  26.43 
 
 
608 aa  106  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1459  flagellar hook-associated protein FlgK  26.6 
 
 
608 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  30.48 
 
 
652 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  24.87 
 
 
541 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  32.39 
 
 
657 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1640  flagellar hook-associated protein FlgK  26.43 
 
 
608 aa  105  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  34.45 
 
 
629 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  22.57 
 
 
566 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 
686 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  25.23 
 
 
475 aa  103  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  30.45 
 
 
640 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  26.75 
 
 
696 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  25.49 
 
 
472 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  28.14 
 
 
676 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  33.94 
 
 
641 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.09 
 
 
685 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  25.42 
 
 
457 aa  101  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 
715 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  27.89 
 
 
549 aa  100  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
702 aa  100  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  29.33 
 
 
630 aa  99.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  26.99 
 
 
482 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  31.51 
 
 
695 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  30.56 
 
 
619 aa  98.6  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 
456 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  23.87 
 
 
453 aa  96.7  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>