263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2524 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  56.35 
 
 
696 aa  800    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  49.57 
 
 
697 aa  674    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
702 aa  1435    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  56.7 
 
 
698 aa  805    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  44.32 
 
 
715 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  37.89 
 
 
690 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  36.55 
 
 
478 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  31.09 
 
 
566 aa  140  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  35.48 
 
 
464 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  34.94 
 
 
477 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  34.26 
 
 
858 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  35.18 
 
 
465 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  34.77 
 
 
456 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  34.02 
 
 
532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  33.2 
 
 
838 aa  121  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  30.92 
 
 
477 aa  120  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  30.34 
 
 
583 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  34.2 
 
 
486 aa  118  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  29.55 
 
 
560 aa  118  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  29.74 
 
 
489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  29.28 
 
 
525 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  34.96 
 
 
647 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  30.77 
 
 
920 aa  114  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 
623 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  30.25 
 
 
588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  30.2 
 
 
547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  27.49 
 
 
568 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  30.2 
 
 
547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  30.53 
 
 
531 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  29.96 
 
 
653 aa  111  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  28 
 
 
623 aa  110  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  30.04 
 
 
554 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  30.04 
 
 
554 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  30.04 
 
 
554 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 
609 aa  110  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  30.33 
 
 
645 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  30.33 
 
 
645 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  28.46 
 
 
480 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  33.86 
 
 
458 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  29.96 
 
 
642 aa  107  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  33.78 
 
 
570 aa  107  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  29.36 
 
 
541 aa  107  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  31.66 
 
 
672 aa  107  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  27.92 
 
 
642 aa  107  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
471 aa  107  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  30.85 
 
 
637 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  30.67 
 
 
644 aa  106  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  31.02 
 
 
645 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  30.77 
 
 
680 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  29.8 
 
 
553 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  29.8 
 
 
553 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  29.8 
 
 
553 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  29.8 
 
 
553 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  31.78 
 
 
691 aa  105  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  29.8 
 
 
553 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  26.53 
 
 
847 aa  104  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  32.32 
 
 
614 aa  104  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  27.8 
 
 
683 aa  103  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  29.39 
 
 
642 aa  103  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  30 
 
 
548 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  32.53 
 
 
686 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  29.63 
 
 
638 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  30.74 
 
 
541 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  31.91 
 
 
443 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  31.4 
 
 
682 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0708  flagellar hook-associated protein FlgK  30.04 
 
 
623 aa  102  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00565259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0305  flagellar hook-associated protein FlgK  30.17 
 
 
620 aa  102  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  30.4 
 
 
688 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  28.81 
 
 
641 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  30.42 
 
 
649 aa  101  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  29.29 
 
 
546 aa  101  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 
858 aa  100  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  30.23 
 
 
680 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  30 
 
 
649 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  29.13 
 
 
708 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  28.96 
 
 
586 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
537 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  26.34 
 
 
858 aa  100  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0672  flagellar hook-associated protein FlgK  31.02 
 
 
430 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0730204 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  27.83 
 
 
630 aa  99.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  32.92 
 
 
480 aa  99.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  27.76 
 
 
695 aa  99.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 
686 aa  99  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  27.57 
 
 
640 aa  99  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  31.08 
 
 
482 aa  98.6  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  29.22 
 
 
652 aa  98.6  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  26.45 
 
 
637 aa  98.2  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  26.09 
 
 
846 aa  97.8  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  29.51 
 
 
539 aa  97.8  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  31.09 
 
 
629 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  31.85 
 
 
676 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  32.08 
 
 
482 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  26.72 
 
 
627 aa  95.9  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>