271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3755 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  90.87 
 
 
480 aa  806    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
482 aa  954    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  42.8 
 
 
456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  42.47 
 
 
477 aa  356  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  42.3 
 
 
478 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  41.29 
 
 
477 aa  353  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  40.64 
 
 
465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  33.06 
 
 
464 aa  227  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  30.57 
 
 
525 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  31.2 
 
 
463 aa  187  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  30.96 
 
 
480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  27.57 
 
 
471 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  29.68 
 
 
486 aa  170  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
459 aa  166  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  26.81 
 
 
531 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  30.64 
 
 
443 aa  156  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  26.23 
 
 
464 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  30.1 
 
 
482 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  29.58 
 
 
457 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  27.88 
 
 
489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  28.02 
 
 
458 aa  147  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  24.49 
 
 
541 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  30.14 
 
 
560 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.02 
 
 
475 aa  133  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  29.42 
 
 
466 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  27.91 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  29.14 
 
 
858 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  29.14 
 
 
858 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  27.7 
 
 
469 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  28.24 
 
 
920 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  26.68 
 
 
472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  27.51 
 
 
818 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  32.37 
 
 
698 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  27.64 
 
 
455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  31.3 
 
 
637 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2563  flagellar hook-associated protein FlgK  27.97 
 
 
481 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  32.27 
 
 
570 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  26.99 
 
 
537 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  29.45 
 
 
647 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  23.98 
 
 
627 aa  115  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  26.78 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 
454 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  32.08 
 
 
702 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1663  flagellar hook-associated protein FlgK  35.69 
 
 
1365 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 
847 aa  114  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0672  flagellar hook-associated protein FlgK  27.07 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0730204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  32.78 
 
 
697 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  26 
 
 
614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  29.72 
 
 
1363 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  30.7 
 
 
541 aa  111  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  26.39 
 
 
630 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  26.26 
 
 
458 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  28.53 
 
 
676 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  25.51 
 
 
623 aa  109  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  26.33 
 
 
458 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1710  flagellar hook-associated protein FlgK  29.44 
 
 
1363 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447823  normal  0.0702953 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  30.11 
 
 
638 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2609  flagellar hook-associated protein FlgK  25.89 
 
 
469 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0376926  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  26.63 
 
 
846 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  26.87 
 
 
838 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.15 
 
 
685 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  26.47 
 
 
453 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0391  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 
484 aa  106  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0799381  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  25.1 
 
 
475 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  26.79 
 
 
583 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  28.5 
 
 
547 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1262  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 
450 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237896  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1459  flagellar hook-associated protein FlgK  27.61 
 
 
608 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  27.24 
 
 
482 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  27.04 
 
 
608 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2513  flagellar hook-associated protein FlgK  25.47 
 
 
469 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00819132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  28.12 
 
 
547 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 
547 aa  104  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  28.12 
 
 
547 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  27.97 
 
 
547 aa  104  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
554 aa  103  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
554 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
554 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  25.58 
 
 
453 aa  103  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  31.93 
 
 
682 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  27.85 
 
 
547 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1640  flagellar hook-associated protein FlgK  27.04 
 
 
608 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  28.07 
 
 
568 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  27.57 
 
 
683 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  29.58 
 
 
696 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.16 
 
 
682 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  27.57 
 
 
547 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  27.85 
 
 
547 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  27.57 
 
 
547 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  25.72 
 
 
644 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 
645 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  24.46 
 
 
429 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  26.89 
 
 
549 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  27.01 
 
 
617 aa  100  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  29.19 
 
 
548 aa  100  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  25.14 
 
 
623 aa  100  6e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 
457 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  28.65 
 
 
642 aa  100  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  28.86 
 
 
553 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>