241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4680 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
429 aa  864    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  45.6 
 
 
452 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  45.14 
 
 
452 aa  348  9e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  35.08 
 
 
458 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  34.85 
 
 
458 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  34.94 
 
 
455 aa  246  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  30.54 
 
 
457 aa  233  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  31.99 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  31.44 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  30.25 
 
 
453 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  30.02 
 
 
453 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 
454 aa  192  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  31.15 
 
 
457 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  31.53 
 
 
457 aa  186  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  28.96 
 
 
457 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  25.84 
 
 
464 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  29.13 
 
 
681 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  25.11 
 
 
486 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.54 
 
 
682 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  28.62 
 
 
683 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  26.62 
 
 
688 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 
680 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  31.93 
 
 
676 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  26.79 
 
 
640 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  26.84 
 
 
477 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 
682 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  27.3 
 
 
680 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  28.49 
 
 
657 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  25.74 
 
 
480 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.81 
 
 
649 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
652 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.58 
 
 
649 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  23.8 
 
 
475 aa  103  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  26.2 
 
 
464 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  26.97 
 
 
686 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  27.21 
 
 
548 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  27.63 
 
 
631 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  24.95 
 
 
478 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  27.16 
 
 
631 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  26.34 
 
 
456 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  26.45 
 
 
685 aa  99.8  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  26.16 
 
 
630 aa  99.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  26.52 
 
 
549 aa  99.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  29.22 
 
 
647 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  29.07 
 
 
554 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  29.07 
 
 
554 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  29.07 
 
 
554 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  25.74 
 
 
686 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  25.9 
 
 
637 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  24.94 
 
 
458 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  23.33 
 
 
541 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  29.49 
 
 
695 aa  97.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
531 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  26.1 
 
 
681 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  23.73 
 
 
920 aa  96.7  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  27.59 
 
 
657 aa  96.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  28.66 
 
 
541 aa  96.3  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  25.43 
 
 
477 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1534  flagellar hook-associated protein FlgK  27.36 
 
 
551 aa  94  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  26.06 
 
 
640 aa  94  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  27.41 
 
 
657 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  28.25 
 
 
653 aa  93.2  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  27.43 
 
 
482 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  25.84 
 
 
640 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  24.95 
 
 
475 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  29.72 
 
 
659 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  24.59 
 
 
638 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  28.48 
 
 
539 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  23.87 
 
 
665 aa  91.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  26.35 
 
 
546 aa  90.9  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  25.62 
 
 
547 aa  90.1  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  25.11 
 
 
459 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  24.95 
 
 
489 aa  89.7  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  24.93 
 
 
553 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  26.67 
 
 
386 aa  89  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  24.93 
 
 
553 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  24.93 
 
 
553 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  28.31 
 
 
643 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  24.55 
 
 
637 aa  89  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  25.82 
 
 
639 aa  88.6  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  28.31 
 
 
643 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  24.93 
 
 
553 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  28.31 
 
 
643 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  24.93 
 
 
553 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  25.31 
 
 
547 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  25.31 
 
 
547 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  25.31 
 
 
547 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
667 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  25.31 
 
 
547 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  24.78 
 
 
463 aa  87.8  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  25.31 
 
 
547 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
714 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  25.31 
 
 
547 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  25.31 
 
 
547 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
667 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  25.82 
 
 
637 aa  87.4  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
667 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
667 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
667 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>