266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3228 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  74.86 
 
 
541 aa  845    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
531 aa  1088    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  37.71 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  36.55 
 
 
480 aa  293  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  35.67 
 
 
471 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  33.21 
 
 
525 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  32.84 
 
 
489 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  34.73 
 
 
838 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  38.24 
 
 
570 aa  228  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  31.57 
 
 
537 aa  220  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  30.67 
 
 
478 aa  219  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  31.57 
 
 
477 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  34.57 
 
 
583 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  46.61 
 
 
568 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  33.78 
 
 
623 aa  203  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  30.99 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  42.45 
 
 
858 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  29.04 
 
 
477 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  29.87 
 
 
456 aa  194  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  30 
 
 
482 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  29.71 
 
 
464 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  31.28 
 
 
847 aa  185  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  32.27 
 
 
586 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  28.44 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  27.58 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  29.95 
 
 
858 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  29.95 
 
 
858 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  29.06 
 
 
463 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  28.73 
 
 
463 aa  171  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  28.07 
 
 
637 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 
846 aa  167  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  28.18 
 
 
627 aa  166  6.9999999999999995e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 
465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.31 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  30.6 
 
 
708 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  34.87 
 
 
818 aa  156  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  28.63 
 
 
466 aa  154  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  26.2 
 
 
472 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  37.17 
 
 
532 aa  150  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  27.88 
 
 
458 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  27.65 
 
 
480 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  31.55 
 
 
637 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  26.81 
 
 
482 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2563  flagellar hook-associated protein FlgK  25.88 
 
 
481 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  33.2 
 
 
647 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  27.98 
 
 
469 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  32.91 
 
 
613 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0305  flagellar hook-associated protein FlgK  30.42 
 
 
620 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  33.04 
 
 
443 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  24.44 
 
 
475 aa  130  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  27.22 
 
 
457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  26.36 
 
 
458 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  26.16 
 
 
458 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  26.06 
 
 
457 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  28.91 
 
 
539 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  28.97 
 
 
631 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0672  flagellar hook-associated protein FlgK  31.63 
 
 
430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0730204 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  29.81 
 
 
560 aa  115  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  30.71 
 
 
640 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  25.66 
 
 
920 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
547 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
547 aa  114  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
547 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
547 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 
640 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
547 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
547 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  29.48 
 
 
547 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  29.72 
 
 
553 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  29.48 
 
 
547 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  29.72 
 
 
553 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  29.72 
 
 
553 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  29.72 
 
 
553 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  29.72 
 
 
553 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2609  flagellar hook-associated protein FlgK  25.95 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0376926  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  28.46 
 
 
546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  27.66 
 
 
696 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2513  flagellar hook-associated protein FlgK  26.84 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00819132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  25.38 
 
 
457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  30.53 
 
 
702 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  29.23 
 
 
548 aa  111  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1351  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
440 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  31.25 
 
 
642 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  28.34 
 
 
640 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  30.38 
 
 
683 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  26.19 
 
 
455 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  30.58 
 
 
549 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  23.75 
 
 
457 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  29.6 
 
 
698 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  28.33 
 
 
631 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  23.9 
 
 
457 aa  107  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  24.1 
 
 
457 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  27.03 
 
 
644 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  30.56 
 
 
642 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.94 
 
 
685 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  26.7 
 
 
672 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  28.4 
 
 
690 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  27.25 
 
 
691 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  28.35 
 
 
653 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>