269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0328 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  48.85 
 
 
858 aa  805    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  66.23 
 
 
847 aa  1179    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  48.62 
 
 
858 aa  806    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
846 aa  1720    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  37.46 
 
 
818 aa  542  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  31.61 
 
 
471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  29.86 
 
 
637 aa  179  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 
568 aa  171  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  29.56 
 
 
838 aa  169  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  26.78 
 
 
541 aa  168  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  31.03 
 
 
486 aa  167  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 
531 aa  167  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  27.89 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  30.47 
 
 
570 aa  161  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  29.67 
 
 
480 aa  156  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  29.38 
 
 
489 aa  150  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  30.31 
 
 
858 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  34.72 
 
 
532 aa  148  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 
627 aa  144  7e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  26.43 
 
 
623 aa  144  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  28.4 
 
 
647 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 
443 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  25.6 
 
 
537 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  27.81 
 
 
478 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  28.32 
 
 
708 aa  134  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  26.6 
 
 
583 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  26.45 
 
 
477 aa  132  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  28.76 
 
 
519 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  29.63 
 
 
586 aa  127  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 
652 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  27.12 
 
 
631 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  28.01 
 
 
613 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  30.63 
 
 
637 aa  122  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  25.22 
 
 
477 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2563  flagellar hook-associated protein FlgK  29.26 
 
 
481 aa  120  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  27.3 
 
 
549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  25.86 
 
 
472 aa  119  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  26.19 
 
 
685 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  28.04 
 
 
681 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  25.88 
 
 
631 aa  115  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  26.3 
 
 
456 aa  114  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  24.56 
 
 
695 aa  114  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  24.7 
 
 
463 aa  114  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  23.78 
 
 
458 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  23.96 
 
 
463 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0305  flagellar hook-associated protein FlgK  28.33 
 
 
620 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  24.93 
 
 
688 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  25 
 
 
619 aa  112  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  26.14 
 
 
727 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  25.07 
 
 
622 aa  111  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  29.5 
 
 
690 aa  111  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  25.26 
 
 
459 aa  111  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  25.23 
 
 
626 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 
457 aa  110  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  23.27 
 
 
475 aa  110  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  24.84 
 
 
683 aa  110  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  25.66 
 
 
457 aa  109  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  26.53 
 
 
680 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  23.72 
 
 
683 aa  109  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 
457 aa  108  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  27.08 
 
 
697 aa  108  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  24.32 
 
 
482 aa  107  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  27.49 
 
 
464 aa  107  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  25.37 
 
 
638 aa  107  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  25.36 
 
 
629 aa  107  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  24.4 
 
 
920 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
640 aa  107  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  26.55 
 
 
680 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  26.49 
 
 
553 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  26.49 
 
 
553 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  26.49 
 
 
553 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  26.49 
 
 
553 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  26.49 
 
 
553 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  24.47 
 
 
644 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  22.89 
 
 
682 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1551  flagellar hook-associated protein FlgK  23.47 
 
 
432 aa  104  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.890668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1555  flagellar hook-associated protein FlgK  23.53 
 
 
432 aa  104  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1669  flagellar hook-associated protein FlgK  23.47 
 
 
432 aa  104  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1351  flagellar hook-associated protein FlgK  23.88 
 
 
440 aa  104  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1736  flagellar hook-associated protein FlgK  23.73 
 
 
432 aa  104  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  26.61 
 
 
641 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1526  flagellar hook-associated protein FlgK  23.47 
 
 
432 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0305654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1515  flagellar hook-associated protein FlgK  23.47 
 
 
432 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  24.12 
 
 
682 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  25.52 
 
 
645 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  23.63 
 
 
623 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  24.33 
 
 
645 aa  103  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  24.33 
 
 
645 aa  103  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  24.7 
 
 
548 aa  103  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  26.06 
 
 
457 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  26.1 
 
 
660 aa  102  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  25.51 
 
 
641 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  25.51 
 
 
641 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  25.07 
 
 
630 aa  102  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1704  flagellar hook-associated protein FlgK  24 
 
 
432 aa  102  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  24.04 
 
 
676 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  26.02 
 
 
641 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  26.25 
 
 
588 aa  102  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3642  flagellar hook-associated protein FlgK  23.73 
 
 
432 aa  101  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  23.65 
 
 
541 aa  101  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>